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撰稿:
陈占国 (温州医科大学附属第二医院)
审稿:
吕建新 (温州医科大学)
SIL-TAL1融合基因是急性T淋巴细胞白血病(T-ALL)最常见的融合基因,可见于25%的T-ALL。由于1号染色体短臂1p32的微小缺失,即de(1)(p32),导致TAL1 基因和其上游的SIL基因融合形成SIL-TAL1 融合基因。T细胞急性白血病1(TAL1)基因,又称干细胞白血病(SCL)基因,定位于1号染色体短臂1p32。TAL1基因编码3种蛋白质,参与调控造血系统的生成,主要在造血干细胞、巨核细胞、早期红系细胞中表达,在正常成熟B淋巴细胞、T淋巴细胞中不表达。SCL中断位点(SIL)基因在多种增生活跃的细胞和T细胞中均有表达,所编码的SIL蛋白在有丝分裂期的磷酸化对细胞周期的维持起重要作用,SIL基因异常表达可导致多种癌症的发生。SIL基因和TAL1基因发生融合后,TAL1基因在SIL基因启动子的调控之下,导致SIL-TAL1过度表达,诱发T-ALL疾病。 根据断裂点的不同,SIL-TAL1存在三种亚型:①SIL基因第1a外显子与TAL1基因第3外显子融合,它是最主要的融合基因亚型;②SIL基因第1a和第1b外显子与TAL1基因第3外显子融合;③SIL基因第1a外显子与TAL1基因第4外显子融合。该融合基因仅见于T-ALL,它是一个T-ALL良好预后的标志。 SIL-TAL1融合基因的主要检测方法有荧光原位杂交技术(FISH)、定性RT-PCR(电泳法或PCR探针法)和反转录荧光定量PCR方法(RT-qPCR)。因染色体缺失的序列较短(90~100kb),常规细胞遗传学方法检测不到这一异常,需要用FISH或RT-PCR 方法进行检测。FISH方法采用特定的SIL-TAL1探针检测染色体易位,定性RT-PCR方法往往会与多种白血病相关融合基因组合检测,如白血病融合基因筛查定性检测;定量方法有一步法和两步法,一次性检测3种SIL-TAL1融合基因亚型。SIL-TAL1定量计算采用校准化拷贝数(NCN)表示,NCN=(SIL-TAL1的拷贝数/ABL内参基因的拷贝数)×100%。
SIL-TAL1融合基因是急性T淋巴细胞白血病(T-ALL)最常见的融合基因,可见于25%的T-ALL。由于1号染色体短臂1p32的微小缺失,即de(1)(p32),导致TAL1 基因和其上游的SIL基因融合形成SIL-TAL1 融合基因。T细胞急性白血病1(TAL1)基因,又称干细胞白血病(SCL)基因,定位于1号染色体短臂1p32。TAL1基因编码3种蛋白质,参与调控造血系统的生成,主要在造血干细胞、巨核细胞、早期红系细胞中表达,在正常成熟B淋巴细胞、T淋巴细胞中不表达。SCL中断位点(SIL)基因在多种增生活跃的细胞和T细胞中均有表达,所编码的SIL蛋白在有丝分裂期的磷酸化对细胞周期的维持起重要作用,SIL基因异常表达可导致多种癌症的发生。SIL基因和TAL1基因发生融合后,TAL1基因在SIL基因启动子的调控之下,导致SIL-TAL1过度表达,诱发T-ALL疾病。 根据断裂点的不同,SIL-TAL1存在三种亚型:①SIL基因第1a外显子与TAL1基因第3外显子融合,它是最主要的融合基因亚型;②SIL基因第1a和第1b外显子与TAL1基因第3外显子融合;③SIL基因第1a外显子与TAL1基因第4外显子融合。该融合基因仅见于T-ALL,它是一个T-ALL良好预后的标志。 SIL-TAL1融合基因的主要检测方法有荧光原位杂交技术(FISH)、定性RT-PCR(电泳法或PCR探针法)和反转录荧光定量PCR方法(RT-qPCR)。因染色体缺失的序列较短(90~100kb),常规细胞遗传学方法检测不到这一异常,需要用FISH或RT-PCR 方法进行检测。FISH方法采用特定的SIL-TAL1探针检测染色体易位,定性RT-PCR方法往往会与多种白血病相关融合基因组合检测,如白血病融合基因筛查定性检测;定量方法有一步法和两步法,一次性检测3种SIL-TAL1融合基因亚型。SIL-TAL1定量计算采用校准化拷贝数(NCN)表示,NCN=(SIL-TAL1的拷贝数/ABL内参基因的拷贝数)×100%。
【标准名称】:
白血病融合基因(SIL-TAL1)检测
【英文名称】:
detection for SIL-TAL1 fusion gene of leukemia
【分类】:
肿瘤分子生物学检验
【别名】:
认证专家
撰稿

陈占国 (作者空间)

温州医科大学附属第二医院

审稿

吕建新 (作者空间)

温州医科大学

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