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目的 探讨细胞外基质蛋白1(extracellular matrix protein 1,ECM1)在结直肠癌中的表达水平及其临床意义.方法 收集肿瘤基因图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA,cancergenome.nih.gov/)、基因表达汇编(Gene Expression Omnibus,GEO,ncbi.nlm.nih.gov/geo/)数据库中结直肠癌组织及正常组织中的测序数据,分析ECM1在二者之间的表达差异及其与肿瘤的分期、预后的关系;收集重庆市江津区中心医院石蜡保存的标本及-80℃保存的新鲜结直肠癌组织,用免疫组化、RT-qPCR及Western blot检测ECM1在结直肠癌组织中的表达情况,x2检验分析ECM1表达水平与患者临床病理特征之间的相关性,Kaplan-Meier分析ECM1的表达与结直肠癌患者预后之间的关系,Cox比例风险回归模型分析影响结直肠癌患者预后的临床指标.利用GSEA软件对TCGA数据库中结直肠癌ECM1基因进行富集分析,探究ECM1参与结直肠癌发生发展过程的可能调控通路.结果 分析TCGA数据显示,在结直肠癌组织中,ECM1 mRNA的表达明显高于正常组织(P<0.000 1),Ⅲ~Ⅳ期结直肠癌患者表达量明显高于Ⅰ~Ⅱ期患者(P<0.05).GEO数据库生存分析显示,ECM1高表达的患者预后较差(P<0.01).免疫组化、RT-qPCR及Western blot结果证实,ECM1在癌组织中的表达较癌旁正常组织上调(P<0.001),其表达

作者:隆思睿;向德兵;申艺;孙贵银

来源:陆军军医大学学报 2022 年 44卷 6期

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作者:
隆思睿;向德兵;申艺;孙贵银
来源:
陆军军医大学学报 2022 年 44卷 6期
标签:
细胞外基质蛋白1;结直肠癌;病理特征;预后;肿瘤转移
目的 探讨细胞外基质蛋白1(extracellular matrix protein 1,ECM1)在结直肠癌中的表达水平及其临床意义.方法 收集肿瘤基因图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA,cancergenome.nih.gov/)、基因表达汇编(Gene Expression Omnibus,GEO,ncbi.nlm.nih.gov/geo/)数据库中结直肠癌组织及正常组织中的测序数据,分析ECM1在二者之间的表达差异及其与肿瘤的分期、预后的关系;收集重庆市江津区中心医院石蜡保存的标本及-80℃保存的新鲜结直肠癌组织,用免疫组化、RT-qPCR及Western blot检测ECM1在结直肠癌组织中的表达情况,x2检验分析ECM1表达水平与患者临床病理特征之间的相关性,Kaplan-Meier分析ECM1的表达与结直肠癌患者预后之间的关系,Cox比例风险回归模型分析影响结直肠癌患者预后的临床指标.利用GSEA软件对TCGA数据库中结直肠癌ECM1基因进行富集分析,探究ECM1参与结直肠癌发生发展过程的可能调控通路.结果 分析TCGA数据显示,在结直肠癌组织中,ECM1 mRNA的表达明显高于正常组织(P<0.000 1),Ⅲ~Ⅳ期结直肠癌患者表达量明显高于Ⅰ~Ⅱ期患者(P<0.05).GEO数据库生存分析显示,ECM1高表达的患者预后较差(P<0.01).免疫组化、RT-qPCR及Western blot结果证实,ECM1在癌组织中的表达较癌旁正常组织上调(P<0.001),其表达