目的 对北京市一起手足口病聚集疫情进行病原学鉴定,明确其来源及基因组进化特征.方法 收集7份患者咽拭子样本,用荧光定量RT-PCR方法鉴定病原血清型.用RT-PCR扩增VP1片段并构建进化树,用于判断基因分型.RT-PCR扩增全基因组序列,计算各基因片段与参考株相似性,分析其基因重组及分子进化特征.结果 该起手足口病聚集疫情由B5亚型人肠道病毒A组71型(human enterovirus 71,EV-A71)引起.全基因组序列比对结果显示,各段基因均与B5亚型EV-A71参考株具有最高的相似性.基因重组分析结果表明,B5亚型EV-A71在进化过程中不断与A组肠道病毒在5'UTR区、P2区和P3区发生基因重组.结论 应密切监测输入性手足口病病例,关注EV-A71基因变异特征,评估现有疫苗对输入病毒的保护效力.
作者：李洁；霍达；徐宝麟；高鹏；李夫；杨扬；王小莉；贾蕾；王全意
来源：国际病毒学杂志 2019 年 26卷 5期
