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目的 探索幼年特发性关节炎(JIA)的发病机理,并找到可能在JIA中起重要作用的分子靶标.方法 通过分析美国国家生物信息技术中心(NCBI)的公共基因芯片数据库(GEO)中关于JIA研究的表达谱芯片数据,找到JIA的差异表达基因,并通过GLAD4U和ToppGene数据库对差异表达基因进行优化和补充,找到JIA的致病基因,利用DAVID在线工具对致病基因进行功能富集分析,探索JIA发病和发展过程中发生的主要生物过程及其重要的基因.结果 得到了JIA的致病基因列表及这些基因所富集的功能,找到了可能在JIA中发挥重要作用的生化通路,如细胞因子与细胞因子受体相互作用(Cytokine-cytokine receptor interaction) 、Jak-STAT信号通路(Jak-STAT signaling pathway)等.结论 通过生物信息学分析的方法了解JIA的发病机理,找到可能致病的候选基因,为实验研究和临床治疗节约时间和成本.

作者:李辉;史占雷;杨帅;王顺义

来源:国际生物医学工程杂志 2015 年 38卷 2期

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作者:
李辉;史占雷;杨帅;王顺义
来源:
国际生物医学工程杂志 2015 年 38卷 2期
标签:
基因芯片 幼年特发性关节炎 生物信息学 Gene microarray Juvenile idiopathic arthritis Bioinformatics
目的 探索幼年特发性关节炎(JIA)的发病机理,并找到可能在JIA中起重要作用的分子靶标.方法 通过分析美国国家生物信息技术中心(NCBI)的公共基因芯片数据库(GEO)中关于JIA研究的表达谱芯片数据,找到JIA的差异表达基因,并通过GLAD4U和ToppGene数据库对差异表达基因进行优化和补充,找到JIA的致病基因,利用DAVID在线工具对致病基因进行功能富集分析,探索JIA发病和发展过程中发生的主要生物过程及其重要的基因.结果 得到了JIA的致病基因列表及这些基因所富集的功能,找到了可能在JIA中发挥重要作用的生化通路,如细胞因子与细胞因子受体相互作用(Cytokine-cytokine receptor interaction) 、Jak-STAT信号通路(Jak-STAT signaling pathway)等.结论 通过生物信息学分析的方法了解JIA的发病机理,找到可能致病的候选基因,为实验研究和临床治疗节约时间和成本.