目的:利用定量蛋白组学方法检测涂阴肺结核(SNP-TB)患者血清差异表达蛋白,并验证关键蛋白FCN3.方法:采用iTRAQ标记结合MALDI-TOF/MS筛选30例健康对照者和30例SNP-TB患者血清的差异表达蛋白,并进行生物信息学分析,对关键差异蛋白FCN3进一步ELISA验证,并绘制ROC曲线.结果:3次独立重复实验一共筛选和鉴定到344种蛋白质,其中置信度在95%以上有283种蛋白质;以正常人血清为对照,SNP-TB患者血清中呈显著性差异表达的蛋白有26种(P<0.05);生物信息学分析发现差异蛋白主要定位在细胞外,参与酶抑制剂活性和应激反应过程;蛋白相互作用发现FCN3等9种蛋白处于相互作用网络关键节点;ELISA验证SNP-TB组血清FCN3蛋白表达水平显著低于正常对照组和涂阳肺结核组(P<0.001),与蛋白组学结果一致;ROC曲线下的面积为0.929,灵敏度和特异度分别是81.24%和83.31%.结论:iTRAQ标记结合MALDI-TOF/MS技术能够有效的筛选和鉴定血清差异表达蛋白;FCN3是值得进一步研究的肺结核候选血清标志物.
作者:周颖;李翠萍;何晓;李洪涛;臧宁;郑艳燕;何敏
来源:广西医科大学学报 2016 年 33卷 2期