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目的 探讨单核苷酸多态性(SNP)间的上位作用对类风湿性关节炎产生的影响.方法 依据人类基因,复杂疾病相关信号通路,以及人类蛋白质互作网络识别3个不同层面互作的SNP对.采用Logistic回归模型来检测互作SNP与疾病的显著相关性.结果 分析疾病相关SNP对,获得34个潜在的类风湿性关节炎疾病风险基因,其中5个为类风湿性关节炎已知疾病基因,16个已有文献证实为疾病风险基因.结论 通过对SNP间上位效应的研究可获得类风湿性关节炎新的潜在疾病基因.

作者:李怡然;周艳艳;黄昊;侯敏;朱莉娜;李琬;陈丽娜

来源:哈尔滨医科大学学报 2015 年 49卷 3期

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作者:
李怡然;周艳艳;黄昊;侯敏;朱莉娜;李琬;陈丽娜
来源:
哈尔滨医科大学学报 2015 年 49卷 3期
标签:
类风湿性关节炎 互作 单核苷酸多态性 全基因组关联研究 rheumatic arthritis interaction SNP genome-wide association studies
目的 探讨单核苷酸多态性(SNP)间的上位作用对类风湿性关节炎产生的影响.方法 依据人类基因,复杂疾病相关信号通路,以及人类蛋白质互作网络识别3个不同层面互作的SNP对.采用Logistic回归模型来检测互作SNP与疾病的显著相关性.结果 分析疾病相关SNP对,获得34个潜在的类风湿性关节炎疾病风险基因,其中5个为类风湿性关节炎已知疾病基因,16个已有文献证实为疾病风险基因.结论 通过对SNP间上位效应的研究可获得类风湿性关节炎新的潜在疾病基因.