目的:运用网络药理学和分子对接技术探讨芪参益气滴丸改善心肌缺血再灌注损伤(myocardium ischemia-reperfu-sion injury,MIRI)的潜在作用机制.方法:从TCMSP数据库、PubChem数据库、Swiss Target Prediction数据库中获取芪参益气滴丸的活性成分及其作用靶点;应用GeneCards、OMIM、GenCLiP 3数据库筛选与MIRI相关的靶点.通过Uniprot数据库对芪参益气滴丸和MIRI的作用靶点进行标准化,再利用Veney 2.1软件取交集,获得共同靶点.应用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络图,并筛选核心作用靶点,然后用R包对这些核心作用靶点进行GO分析和KEGG分析.利用Cytoscape软件构建芪参益气滴丸"中药-成分-靶标-通路网络",并通过Autodock Vina软件对网络中degree排名前5位的核心作用靶点与其所对应的活性成分进行分子对接.结果:筛选出芪参益气滴丸125个活性成分,350个作用靶点,获得1 475个与MIRI相关的作用靶点,取交集后获得181个共同作用靶点,网络拓扑分析后获得19个核心作用靶点.GO分析根据P≤0.05共确定了 1 871个条目,其中生物过程1 763条,分子功能77条,细胞组成31条;KEGG分析根据P≤0.05共映射出了 146条信号通路,其中前30条通路中有10条与MIRI密切相关.分子对接
作者:王建茹;朱明军;王永霞;彭广操
来源:中医学报 2021 年 36卷 7期