目的:基于肿瘤基因组图谱数据库(TCGA)架构肺腺癌(LUAD)竞争内源性RNA(ceRNA)网络,鉴定潜在的生存关联性生物标志物,并确定特异性治疗的小分子药物.方法:依据纳入研究标准,利用Edger软件筛选LUAD组织与正常组织(mRNA、lncRNA和miRNA)差异表达的基因.通过miRcode、miRDB、Tar-getScan和miRanda数据库对差异表达的RNA之间的关系进行分析,构建ceRNA网络.采用Kaplan-Meier方法分析ceRNA网络中的RNA表达量与生存预后的关系,通过富集分析对网络中的mRNA基因功能和调控通路进行分析.通过Cmap数据库筛选治疗LUAD的特异性小分子药物.利用D-lnc软件确定与关键的lncRNA相关的特异性小分子药物.结果:mRNAs(ELAVL2和PBK)、miRNAs(miR-13和miR-210)和lncRNAs(AP002478.1、DSCAM-AS1、LINC00269、LINC00470和LINC00483)与总生存期(OS)关系密切.喜树碱和甲萘醌有可能逆转LUAD的状态.卡铂、多西紫杉醇、帕比司他被确定为与关键lncRNA密切相关的药物.结论:ceRNA网络在LUAD中发挥重要作用,多种差异表达RNA与LUAD预后相关,可能成为潜在的肿瘤诊断标志物和治疗靶点.
作者:李经蕾;胡帅航;周彤;樊柄杰;侯炜
来源:现代肿瘤医学 2020 年 28卷 24期