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目的:运用生物信息学技术探索转移性前列腺癌的关键基因及作用于关键基因的化学药物,并通过实验验证化学药物的治疗效果.方法:使用生物信息学技术及相关工具对GEO数据集GSE27616、GSE38241、GSE168718中转移性前列腺癌和非转移性前列腺癌的基因表达数据进行差异表达分析,使用STRING数据库、Cytoscape软件和人类蛋白表达图集(HPA)获取较差预后相关的关键基因,使用比较毒理学数据库(CTD)对关键基因的互作化学药物进行集合重叠分析.使用CCK-8法、平板克隆形成实验验证关键化学药物的效果.结果:差异表达分析获得差异表达基因共105个,其中下调基因79个,上调基因26个.STRING数据库、Cytoscape软件、人类蛋白表达图集(HPA)生存分析结果显示6个基因在前列腺癌组织中高表达且与较差预后有关(P<0.05).使用CTD数据库分析较差预后相关基因,得出8个关键化学药物,通过CCK-8法、平板克隆形成实验最终证实1,2,4-苯三酸酐、环氧化苯并芘、达沙替尼、曲格列酮和舒尼替尼5种药物具有抑制转移性前列腺癌细胞系增殖的作用.结论:1,2,4-苯三酸酐、环氧化苯并芘、达沙替尼、曲格列酮和舒尼替尼5种化学药物能够抑制转移性前列腺癌细胞的增殖,为临床治疗转移性前列腺癌提供候选药物.

作者:冯源康;黄珍林;王军;李翔;刘若阳;李松超;杨锦建;贾占奎

来源:现代肿瘤医学 2022 年 30卷 15期

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作者:
冯源康;黄珍林;王军;李翔;刘若阳;李松超;杨锦建;贾占奎
来源:
现代肿瘤医学 2022 年 30卷 15期
标签:
前列腺癌 生物信息学 差异表达基因 化学药物
目的:运用生物信息学技术探索转移性前列腺癌的关键基因及作用于关键基因的化学药物,并通过实验验证化学药物的治疗效果.方法:使用生物信息学技术及相关工具对GEO数据集GSE27616、GSE38241、GSE168718中转移性前列腺癌和非转移性前列腺癌的基因表达数据进行差异表达分析,使用STRING数据库、Cytoscape软件和人类蛋白表达图集(HPA)获取较差预后相关的关键基因,使用比较毒理学数据库(CTD)对关键基因的互作化学药物进行集合重叠分析.使用CCK-8法、平板克隆形成实验验证关键化学药物的效果.结果:差异表达分析获得差异表达基因共105个,其中下调基因79个,上调基因26个.STRING数据库、Cytoscape软件、人类蛋白表达图集(HPA)生存分析结果显示6个基因在前列腺癌组织中高表达且与较差预后有关(P<0.05).使用CTD数据库分析较差预后相关基因,得出8个关键化学药物,通过CCK-8法、平板克隆形成实验最终证实1,2,4-苯三酸酐、环氧化苯并芘、达沙替尼、曲格列酮和舒尼替尼5种药物具有抑制转移性前列腺癌细胞系增殖的作用.结论:1,2,4-苯三酸酐、环氧化苯并芘、达沙替尼、曲格列酮和舒尼替尼5种化学药物能够抑制转移性前列腺癌细胞的增殖,为临床治疗转移性前列腺癌提供候选药物.