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目的 通过分析线粒体功能相关基因在系统性硬化症(SSc)患者皮肤活检组织中的表达情况来研究线粒体和SSc之间的关系.方法 使用基因表达汇编(GEO)数据库中SSc皮肤活检组织基因芯片表达谱数据,采用t检验和倍数变化(FC)的差异基因分析方法筛选出线粒体功能相关的差异表达基因(DEG),并对其进行功能注释、功能富集和蛋白质相互作用网络分析.结果 在SSc组织中共识别出422个显著差异的DEG,其中23个DEG是线粒体功能相关基因.对这23个基因进行功能注释和富集分析,发现异常表达的线粒体功能相关基因主要影响线粒体能量供应、细胞代谢等生物学过程.结论 SSc的发生发展伴随着线粒体功能相关基因的异常表达,提示线粒体功能异常与SSc发病相关.

作者:巴燕娜;苏丽萍;刘曼玲;袁晴;吴振彪;袁志栋

来源:细胞与分子免疫学杂志 2019 年 35卷 8期

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作者:
巴燕娜;苏丽萍;刘曼玲;袁晴;吴振彪;袁志栋
来源:
细胞与分子免疫学杂志 2019 年 35卷 8期
标签:
系统性硬化症(SSc) 线粒体 差异表达基因(DEG)
目的 通过分析线粒体功能相关基因在系统性硬化症(SSc)患者皮肤活检组织中的表达情况来研究线粒体和SSc之间的关系.方法 使用基因表达汇编(GEO)数据库中SSc皮肤活检组织基因芯片表达谱数据,采用t检验和倍数变化(FC)的差异基因分析方法筛选出线粒体功能相关的差异表达基因(DEG),并对其进行功能注释、功能富集和蛋白质相互作用网络分析.结果 在SSc组织中共识别出422个显著差异的DEG,其中23个DEG是线粒体功能相关基因.对这23个基因进行功能注释和富集分析,发现异常表达的线粒体功能相关基因主要影响线粒体能量供应、细胞代谢等生物学过程.结论 SSc的发生发展伴随着线粒体功能相关基因的异常表达,提示线粒体功能异常与SSc发病相关.