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目的 了解江西省大别山病毒的基因特征.方法 对2017年收集的经直接免疫荧光法检测为汉坦病毒阳性的鼠肺标本进行汉坦病毒全S和部分M基因片段RT-PCR扩增,对扩增产物进行TA克隆和测序,运用DNAstar软件对获得的序列进行分析.结果2017年共收集鼠肺标本537份,直接免疫荧光法检出14份汉坦病毒阳性,对其中的6份进行RT-PCR扩增.经序列分析表明,有2株(GAXW 19/2017、GAXW20/2017)为大别山病毒.获得的GAXW 19/2017、GAXW20/2017全S基因和部分M基因核苷酸同源性均为100%.S基因全长1 725 bp,编码429个氨基酸.全S基因与大别山病毒NC167株核苷酸同源性88.6%、氨基酸同源性为98.4%,部分M基因与NC167株核苷酸同源性86.4%,氨基酸同源性分别为99.0%;与其他型别汉坦病毒比较,S和部分M基因核苷酸同源性均小于80%,氨基酸同源性均小于93%.在汉坦病毒S和M基因进化树上,GAXW19/2017、GAXW20/2017均分布在大别山病毒分支且独立分支.结论 GAXW 19/2017、GAXW20/2017为大别山病毒,首次在江西省鼠肺样本中发现大别山病毒.

作者:刘师文;徐刚;龚甜;施勇;肖芳;李健雄;张艳妮;周珺;刘晓庆;熊英

来源:现代预防医学 2018 年 45卷 20期

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刘师文;徐刚;龚甜;施勇;肖芳;李健雄;张艳妮;周珺;刘晓庆;熊英
来源:
现代预防医学 2018 年 45卷 20期
标签:
大别山病毒 基因特征 S基因 M基因
目的 了解江西省大别山病毒的基因特征.方法 对2017年收集的经直接免疫荧光法检测为汉坦病毒阳性的鼠肺标本进行汉坦病毒全S和部分M基因片段RT-PCR扩增,对扩增产物进行TA克隆和测序,运用DNAstar软件对获得的序列进行分析.结果2017年共收集鼠肺标本537份,直接免疫荧光法检出14份汉坦病毒阳性,对其中的6份进行RT-PCR扩增.经序列分析表明,有2株(GAXW 19/2017、GAXW20/2017)为大别山病毒.获得的GAXW 19/2017、GAXW20/2017全S基因和部分M基因核苷酸同源性均为100%.S基因全长1 725 bp,编码429个氨基酸.全S基因与大别山病毒NC167株核苷酸同源性88.6%、氨基酸同源性为98.4%,部分M基因与NC167株核苷酸同源性86.4%,氨基酸同源性分别为99.0%;与其他型别汉坦病毒比较,S和部分M基因核苷酸同源性均小于80%,氨基酸同源性均小于93%.在汉坦病毒S和M基因进化树上,GAXW19/2017、GAXW20/2017均分布在大别山病毒分支且独立分支.结论 GAXW 19/2017、GAXW20/2017为大别山病毒,首次在江西省鼠肺样本中发现大别山病毒.