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目的 分析SERPINE1 在胃癌组织中的表达及其临床意义.方法 通过检索肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库,了解SERPINE1 在33 种癌症组织中的表达情况.通过检索癌症基因组图谱(TCGA)数据库,下载375 例胃癌组织和32 例癌旁组织的RNA-Sep数据和临床信息,通过检索基因综合表达(GEO)数据库GSE54129 数据集下载了111 例胃癌组织和21 例癌旁组织的基因表达谱芯片,分别将TCGA和GSE54129 数据集中的SERPINE1 进行癌组织和癌旁组织的表达差异分析,COX分析TCGA数据集中临床基线资料和SERPINE1 mRNA表达水平对胃癌患者预后的影响.绘制Kaplan-Meier生存曲线和受试者工作特征曲线(ROC)分析SERPINE1 mRNA表达与预后的关系.通过基因富集分析(GSEA)挖掘并预测SERPINE1 参与的通路.结果 TIMER数据库分析表明,SERPINE1 在 8种癌组织中明显高表达(P<0.05).TCGA数据集、GSE54129 数据集分析表明,在胃癌组织中SERPINE1 表达高于癌旁组织(P<0.001).多因素COX分析表明,病理Stage4、SERPINE1 mRNA表达水平高是影响胃癌患者预后生存时间的独立危险因素[HR(95%CI)=3.061(1.107~8.464)、1.778(1.224~2.582),P<0.05)].Kaplan-Meier生存曲线分析发现,SERPINE1 高表达组总生存期明显低于低表达组(P<0.001).ROC曲线分析发现,SERPINE1 表

作者:周涛;王笑天;刘东;孔斌;赵士彭

来源:疑难病杂志 2023 年 22卷 1期

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作者:
周涛;王笑天;刘东;孔斌;赵士彭
来源:
疑难病杂志 2023 年 22卷 1期
标签:
胃癌 SERPINE1 癌症基因组图谱数据库 基因表达数据库 预后
目的 分析SERPINE1 在胃癌组织中的表达及其临床意义.方法 通过检索肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库,了解SERPINE1 在33 种癌症组织中的表达情况.通过检索癌症基因组图谱(TCGA)数据库,下载375 例胃癌组织和32 例癌旁组织的RNA-Sep数据和临床信息,通过检索基因综合表达(GEO)数据库GSE54129 数据集下载了111 例胃癌组织和21 例癌旁组织的基因表达谱芯片,分别将TCGA和GSE54129 数据集中的SERPINE1 进行癌组织和癌旁组织的表达差异分析,COX分析TCGA数据集中临床基线资料和SERPINE1 mRNA表达水平对胃癌患者预后的影响.绘制Kaplan-Meier生存曲线和受试者工作特征曲线(ROC)分析SERPINE1 mRNA表达与预后的关系.通过基因富集分析(GSEA)挖掘并预测SERPINE1 参与的通路.结果 TIMER数据库分析表明,SERPINE1 在 8种癌组织中明显高表达(P<0.05).TCGA数据集、GSE54129 数据集分析表明,在胃癌组织中SERPINE1 表达高于癌旁组织(P<0.001).多因素COX分析表明,病理Stage4、SERPINE1 mRNA表达水平高是影响胃癌患者预后生存时间的独立危险因素[HR(95%CI)=3.061(1.107~8.464)、1.778(1.224~2.582),P<0.05)].Kaplan-Meier生存曲线分析发现,SERPINE1 高表达组总生存期明显低于低表达组(P<0.001).ROC曲线分析发现,SERPINE1 表