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目的:探索甲状腺乳头状癌(PTC)在诊断和预后判断的关键因素.方法:通过下载NCBI-GEO的3个甲状腺乳头状癌数据集并应用R语言进行关键基因的筛选,结合TCGA数据集及在线分析网站对其进行综合分析.同时,利用RTPCR对50例甲状腺乳头状癌及癌旁组织进行mRNA表达量检测.结果:从3个甲状腺乳头状癌GEO数据集中鉴定出142个差异表达基因,在50例甲状腺乳头状癌组织中检测到FN1表达显著上升且BRAF-V600E基因突变的甲状腺乳头状癌组织中有着更高的FN1表达水平.此外,FN1的表达水平与甲状腺乳头状癌中的不良预后及免疫浸润密切相关,基因共表达分析结果显示FN1共表达的基因富集在p53信号通路.结论:FN1可作为甲状腺乳头状癌诊断及预后标志物,同时FN1在甲状腺乳头状癌中的作用机制可能与BRAF-V600E突变、免疫浸润及p53信号通路相关.

作者:陈兴;郑俊杰;张爱龙;游振辉

来源:中国免疫学杂志 2021 年 37卷 15期

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作者:
陈兴;郑俊杰;张爱龙;游振辉
来源:
中国免疫学杂志 2021 年 37卷 15期
标签:
甲状腺乳头状癌 FN1 BRAF突变 免疫浸润 p53信号通路 生物信息学
目的:探索甲状腺乳头状癌(PTC)在诊断和预后判断的关键因素.方法:通过下载NCBI-GEO的3个甲状腺乳头状癌数据集并应用R语言进行关键基因的筛选,结合TCGA数据集及在线分析网站对其进行综合分析.同时,利用RTPCR对50例甲状腺乳头状癌及癌旁组织进行mRNA表达量检测.结果:从3个甲状腺乳头状癌GEO数据集中鉴定出142个差异表达基因,在50例甲状腺乳头状癌组织中检测到FN1表达显著上升且BRAF-V600E基因突变的甲状腺乳头状癌组织中有着更高的FN1表达水平.此外,FN1的表达水平与甲状腺乳头状癌中的不良预后及免疫浸润密切相关,基因共表达分析结果显示FN1共表达的基因富集在p53信号通路.结论:FN1可作为甲状腺乳头状癌诊断及预后标志物,同时FN1在甲状腺乳头状癌中的作用机制可能与BRAF-V600E突变、免疫浸润及p53信号通路相关.