目的 分析2010年昆明市引起手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)的病原埃可病毒9型(Echo virus 9,E9)分离株MSH-KM812 VP1基因的遗传特征.方法 分别采用RD细胞和Hep-2细胞对3份HFMD患儿粪便标本进行病毒分离,应用RT-PCR法分2段扩增病毒VP1基因,并进行序列测定.应用NCBI BLAST软件对所测定的节段序列进行比对;Omiga软件对所测定的节段序列的核苷酸及推导的氨基酸序列进行编辑、比对和拼接;应用Mega 5.05软件进行序列分析,并与15个E9参考株的VP1基因序列进行比较,构建基因系统进化树.结果 从3份HFMD患儿粪便标本中分离到1株E9,命名为MSH-KM812,其VP1区的核苷酸长度为888 bp.MSH-KM812株与其他15个E9参考株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为78.6% ~ 98.0%和87.5% ~ 99.3%,与中国分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为92.7%~98.0%和97.0% ~ 99.3%,其中与中国江苏分离株M10MF37 China 2010核苷酸和氨基酸序列同源性最高,分别为98.0%和99.3%,而与德国分离株Hill的核苷酸和氨基酸序列同源性最低,分别为78.6%和87.5%.基因进化树分析显示,MSH-KM812分离株与中国江苏分离株M10MF37 China 2010和中国山东分离株05189-SD-CHN-2005-E9属于同一个进化分枝.结论 MSH-KM812分离株为E9,与中国
作者:潘玥;戴素萍;朱艳菊;李丽;邓新强;廖宏玮;刘雅灵;马绍辉
来源:中国生物制品学杂志 2013 年 26卷 3期