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目的 筛选与结直肠癌细胞放疗敏感性相关的长链非编码RNA(lncRNA).方法 将HT29、SW480、RKO、Lovo和HCT116等5株结直肠癌细胞梯度照光后行克隆形成实验,通过细胞存活率(SF2值)来检测5株细胞的放疗敏感性差异;利用高通量lncRNA芯片筛选在SW480、RKO和Lovo细胞株中两两比较表达差异均大于2倍的lncRNA,并通过实时定量PCR进一步检测所选lncRNA在5株结直肠癌细胞中的表达差异.结果 5株结直肠癌细胞放疗敏感性由低至高(即SF2值由高至低)依次为HT29 (0.83±0.03)、SW480 (0.69±0.02)、RKO (0.53±0.02)、Lovo (0.47±0.05)和HCT116(0.32±0.03)(P<0.01).lncRNA芯片筛选得到5种与结直肠癌细胞放疗敏感性相关的lncRNA基因,其中R05532、NR_015441和NR_033374基因表达水平与细胞放疗抵抗呈正相关(均P<0.01),而NR_073156和AA745020基因表达水平与细胞放疗抵抗无明显相关性(均P>0.05).结论 R05532、NR_015441和NR_033374三种lncRNA可能成为结直肠癌细胞放疗敏感性的预测分子,其高表达提示放疗抵抗.

作者:徐小雯;袁捷;左志贵;于志奇;刘永明;傅传刚

来源:中华胃肠外科杂志 2014 年 17卷 11期

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作者:
徐小雯;袁捷;左志贵;于志奇;刘永明;傅传刚
来源:
中华胃肠外科杂志 2014 年 17卷 11期
标签:
结直肠肿瘤 放疗敏感性 长链非编码RNA 高通量lncRNA芯片 Colorectal neoplasms Radiosensitivity Long non-coding RNA High-throughput lncRNA chip
目的 筛选与结直肠癌细胞放疗敏感性相关的长链非编码RNA(lncRNA).方法 将HT29、SW480、RKO、Lovo和HCT116等5株结直肠癌细胞梯度照光后行克隆形成实验,通过细胞存活率(SF2值)来检测5株细胞的放疗敏感性差异;利用高通量lncRNA芯片筛选在SW480、RKO和Lovo细胞株中两两比较表达差异均大于2倍的lncRNA,并通过实时定量PCR进一步检测所选lncRNA在5株结直肠癌细胞中的表达差异.结果 5株结直肠癌细胞放疗敏感性由低至高(即SF2值由高至低)依次为HT29 (0.83±0.03)、SW480 (0.69±0.02)、RKO (0.53±0.02)、Lovo (0.47±0.05)和HCT116(0.32±0.03)(P<0.01).lncRNA芯片筛选得到5种与结直肠癌细胞放疗敏感性相关的lncRNA基因,其中R05532、NR_015441和NR_033374基因表达水平与细胞放疗抵抗呈正相关(均P<0.01),而NR_073156和AA745020基因表达水平与细胞放疗抵抗无明显相关性(均P>0.05).结论 R05532、NR_015441和NR_033374三种lncRNA可能成为结直肠癌细胞放疗敏感性的预测分子,其高表达提示放疗抵抗.