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目的 对青海省多房棘球绦虫分离株Cox1、Nad1基因进行扩增和测序,并构建系统进化树及分子钟,为推测其进化关系及起源提供参考依据.方法 收集2017年青海省人民医院收治的22份肝多房棘球蚴病患者术后标本,对多房棘球蚴线粒体DNA Cox1、Nad1基因进行PCR扩增和测序,并与GenBank数据库中的棘球属绦虫Cox1基因和Nad1基因序列进行比对,观察种内变异情况并构建进化树和分子钟.结果 所有多房棘球绦虫标本与GenBank数据库中检索的多房棘球绦虫亚洲株Cox1、Nad1基因序列同源性均达99%以上,共获得6种不同基因型,其中有2个分离株在GenBank数据库中未找到同源性100%的基因序列.系统进化树显示,收集的多房棘球绦虫标本与多房棘球绦虫亚洲株聚类效果明显;分子钟推测青海地区多房棘球绦虫起源于9.4万年前.结论 本研究发现青海省多房棘球绦虫存在6种不同基因型,其中首次发现2种基因型.青海地区多房棘球绦虫优势株为亚洲株,起源时间约在9.4万年前.

作者:朱文君;韩秀敏;蔡其刚;孙艳秋;郭亚民

来源:中国血吸虫病防治杂志 2019 年 31卷 6期

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朱文君;韩秀敏;蔡其刚;孙艳秋;郭亚民
来源:
中国血吸虫病防治杂志 2019 年 31卷 6期
标签:
多房棘球绦虫 Cox1基因 Nad1基因 分子进化 分子钟 青海省
目的 对青海省多房棘球绦虫分离株Cox1、Nad1基因进行扩增和测序,并构建系统进化树及分子钟,为推测其进化关系及起源提供参考依据.方法 收集2017年青海省人民医院收治的22份肝多房棘球蚴病患者术后标本,对多房棘球蚴线粒体DNA Cox1、Nad1基因进行PCR扩增和测序,并与GenBank数据库中的棘球属绦虫Cox1基因和Nad1基因序列进行比对,观察种内变异情况并构建进化树和分子钟.结果 所有多房棘球绦虫标本与GenBank数据库中检索的多房棘球绦虫亚洲株Cox1、Nad1基因序列同源性均达99%以上,共获得6种不同基因型,其中有2个分离株在GenBank数据库中未找到同源性100%的基因序列.系统进化树显示,收集的多房棘球绦虫标本与多房棘球绦虫亚洲株聚类效果明显;分子钟推测青海地区多房棘球绦虫起源于9.4万年前.结论 本研究发现青海省多房棘球绦虫存在6种不同基因型,其中首次发现2种基因型.青海地区多房棘球绦虫优势株为亚洲株,起源时间约在9.4万年前.