目的 利用生物信息学方法探索2型糖尿病发病的相关基因,并研究这些基因与阿尔茨海默病的关系.方法 基因表达汇编(GEO)数据库下载GSE85192、GSE95849、GSE97760、GSE85426数据集,获得健康人和2型糖尿病患者外周血的差异基因,利用加权基因共表达网络(WGCNA)分析差异基因和临床性状的关系.使用DAVID数据库分析与2型糖尿病有关的差异基因的功能与相关通路,筛选关键蛋白.根据结果将Toll样受体4(TLR4)作为关键基因,利用基因集富集分析(GSEA)分析GSE97760中与高表达TLR4基因相关的信号通路.通过GSE85426验证TLR4的表达量.结果 富集分析显示,差异基因主要参与的生物学过程包括炎症反应、Toll样受体(TLR)信号通路、趋化因子产生的正向调节等.差异基因主要参与的信号通路有嘧啶代谢通路、TLR信号通路等.ILF2、TLR4、POLR2G、MMP9为2型糖尿病的关键基因.GSEA显示,TLR4上调可通过影响嘧啶代谢及TLR信号通路而导致2型糖尿病及阿尔茨海默病的发生.TLR4在阿尔茨海默病外周血中高表达.结论 ILF2、TLR4、POLR2G、MMP9为2型糖尿病发病的关键基因,TLR4基因上调与2型糖尿病、阿尔茨海默病发生有关.
作者:辛宁;陈建康;陈艳;杨洁
来源:中国医科大学学报 2020 年 49卷 12期