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目的 筛选 HIV感染相关Burkitt淋巴瘤(Burkitt lymphoma ,BL )与弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B cell lymphoma ,DLBCL)中差异性微小核糖核酸(microRNA ,miRNA).方法 收集上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心5份BL和3份DLBCL新鲜冰冻组织标本,19份BL和15份DLBCL石蜡标本. Agilent human miRNA microarray芯片技术检测新鲜冰冻的BL和DLBCL组织中miRNA表达情况,查找差异miRNA .利用SmartRNAplexTMmiRNA技术在BL和DLBCL石蜡组织中验证关键miRNA ,生物信息学方法预测靶基因.结果 以DLBCL 为参照,BL 组中有42个差异性miRNA ,其中28个miRNA上调,14个miRNA下调.以真核生物正向调控和高表达分子能促进肿瘤发生为依据,从BL组表达上调的miRNA选出5个关键miRNA验证,结果与芯片一致.与DLBCL相比,5个 miRNA 在 BL 中的表达均上调,分别为 miRNA-16-2-3p 、miRNA-20a-3p 、miRNA-130b-3p 、miRNA-185-5p和miRNA-423-5p(t值分别为2 .715 、2 .539 、2 .750 、4 .004和3 .625 ,均 P<0 .05) .其中miRNA-16-2-3p对应的靶基因可能主要为CTNND2和 RAD21 ;miRNA-20a-3p的靶基因可能主要为DYRK1A和GPAM ;miRNA-130b-3p的靶基因可能主要与IRF1 、DICER1 、PTEN等相关;miRNA-185-5p的靶基因可能主要为VEGFA 、NFATC3和SEC24

作者:王迪;曾东;郑叶;张鹏;冯艳玲;卢洪洲

来源:中华传染病杂志 2018 年 36卷 9期

知识库介绍

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作者:
王迪;曾东;郑叶;张鹏;冯艳玲;卢洪洲
来源:
中华传染病杂志 2018 年 36卷 9期
标签:
人类免疫缺陷病毒 Burkitt淋巴瘤 淋巴瘤,大B细胞,弥漫性 微小核糖核酸 临床病理 Human immunodeficiency virus Burkitt lymphoma Lymphoma,large B-cell,diffuse MicroRNA Clinical pathology
目的 筛选 HIV感染相关Burkitt淋巴瘤(Burkitt lymphoma ,BL )与弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B cell lymphoma ,DLBCL)中差异性微小核糖核酸(microRNA ,miRNA).方法 收集上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心5份BL和3份DLBCL新鲜冰冻组织标本,19份BL和15份DLBCL石蜡标本. Agilent human miRNA microarray芯片技术检测新鲜冰冻的BL和DLBCL组织中miRNA表达情况,查找差异miRNA .利用SmartRNAplexTMmiRNA技术在BL和DLBCL石蜡组织中验证关键miRNA ,生物信息学方法预测靶基因.结果 以DLBCL 为参照,BL 组中有42个差异性miRNA ,其中28个miRNA上调,14个miRNA下调.以真核生物正向调控和高表达分子能促进肿瘤发生为依据,从BL组表达上调的miRNA选出5个关键miRNA验证,结果与芯片一致.与DLBCL相比,5个 miRNA 在 BL 中的表达均上调,分别为 miRNA-16-2-3p 、miRNA-20a-3p 、miRNA-130b-3p 、miRNA-185-5p和miRNA-423-5p(t值分别为2 .715 、2 .539 、2 .750 、4 .004和3 .625 ,均 P<0 .05) .其中miRNA-16-2-3p对应的靶基因可能主要为CTNND2和 RAD21 ;miRNA-20a-3p的靶基因可能主要为DYRK1A和GPAM ;miRNA-130b-3p的靶基因可能主要与IRF1 、DICER1 、PTEN等相关;miRNA-185-5p的靶基因可能主要为VEGFA 、NFATC3和SEC24