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目的:建立新型冠状病毒(2019 novel coronavirus,2019-nCoV)的细胞培养和全基因组测序方法,了解2019-nCoV基因变异情况。方法:选取部分2019-nCoV感染的肺炎确诊病例的鼻、咽拭子标本接种Vero-E6细胞培养管进行分离培养,逐日观察病变,对病变的细胞开展荧光定量RT-PCR检测确认病毒分离结果;选取部分分离到的新型冠状病毒进行10倍稀释后接种细胞测定病毒滴度。采用2019-nCoV全基因组捕获技术及二代测序方法对部分分离到的毒株进行全基因组测序,对获得的序列进行序列比对和进化分析,分析其变异位点。结果:在生物安全三级实验室建立2019-nCoV在Vero-E6细胞系中的病毒分离方法,共对150份2019-nCoV阳性病例鼻、咽拭子标本开展病毒分离,共分离到22株2019-nCoV毒株。对其中的18株2019-nCoV开展全基因组测序,获得的基因组序列全长约为29 600 bp,基因同源性在99.9

作者:王建醒;刘倜;姚明晓;陶泽新;房明;李岩;张玉薇;吴巨龙;何玉洁;姜蕾;李忠;姜晓林;康佃民;寇增强

来源:中华实验和临床病毒学杂志 2021 年 35卷 6期

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作者:
王建醒;刘倜;姚明晓;陶泽新;房明;李岩;张玉薇;吴巨龙;何玉洁;姜蕾;李忠;姜晓林;康佃民;寇增强
来源:
中华实验和临床病毒学杂志 2021 年 35卷 6期
标签:
新型冠状病毒 分离鉴定 全基因组分析 (2019 novel coronavirus Isolation Full-genome sequencing
目的:建立新型冠状病毒(2019 novel coronavirus,2019-nCoV)的细胞培养和全基因组测序方法,了解2019-nCoV基因变异情况。方法:选取部分2019-nCoV感染的肺炎确诊病例的鼻、咽拭子标本接种Vero-E6细胞培养管进行分离培养,逐日观察病变,对病变的细胞开展荧光定量RT-PCR检测确认病毒分离结果;选取部分分离到的新型冠状病毒进行10倍稀释后接种细胞测定病毒滴度。采用2019-nCoV全基因组捕获技术及二代测序方法对部分分离到的毒株进行全基因组测序,对获得的序列进行序列比对和进化分析,分析其变异位点。结果:在生物安全三级实验室建立2019-nCoV在Vero-E6细胞系中的病毒分离方法,共对150份2019-nCoV阳性病例鼻、咽拭子标本开展病毒分离,共分离到22株2019-nCoV毒株。对其中的18株2019-nCoV开展全基因组测序,获得的基因组序列全长约为29 600 bp,基因同源性在99.9