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目的 对比分析宏基因二代测序(mNGS)技术及传统病原学检测对不明原因肺部感染患者的诊断价值.方法 选取医院2019年8月-2021年8月收治的118例不明原因肺部感染患者.收集患者临床资料,采集患者痰液、支气管肺泡灌洗液(BALF)、外周血、胸腔积液及肺组织标本等进行传统病原学检测(痰涂片染色及培养、BALF培养、血培养、抗原检测、肺部组织病理检测等)及mNGS技术检测.采用McNemar检验比较mNGS技术与传统病原学检测方法诊断肺部感染的差异,并分别比较两者在有无基础疾病、感染类型中的检出率.结果 所有患者与有基础疾病患者mNGS检测阳性率(87.29%、91.75%)均高于传统病原学检测(55.08%、58.76%)(P<0.05);mNGS检测阳性、阴性结果耗时均短于传统病原学检测(P<0.05);mNGS检测阳性样本高丰度序列占比83.50%(86/103)最高;mNGS在单一型感染及混合型感染的检出率(84.34%、94.29%)均高于传统病原学检测(57.83%、48.57%)(P<0.05).4例经mNGS技术检出耐药基因,共检出5种耐药基因,包括超广谱β-内酰胺酶基因(TEM、SHV、OXA)与碳青霉烯酶基因(IMI、KPC).结论 mNGS技术可有效提高不明原因肺部感染阳性检出率,可辅助评估抗菌药物耐药性基因,在诊断病毒感染、耶氏肺孢子虫感染及混合感染等方面的效果比传统病原学检

作者:何邦立;林亚发;符名勇;王建平;吴毓磊

来源:中华医院感染学杂志 2023 年 33卷 7期

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作者:
何邦立;林亚发;符名勇;王建平;吴毓磊
来源:
中华医院感染学杂志 2023 年 33卷 7期
标签:
宏基因二代测序技术 不明原因 病原体检测 肺部感染
目的 对比分析宏基因二代测序(mNGS)技术及传统病原学检测对不明原因肺部感染患者的诊断价值.方法 选取医院2019年8月-2021年8月收治的118例不明原因肺部感染患者.收集患者临床资料,采集患者痰液、支气管肺泡灌洗液(BALF)、外周血、胸腔积液及肺组织标本等进行传统病原学检测(痰涂片染色及培养、BALF培养、血培养、抗原检测、肺部组织病理检测等)及mNGS技术检测.采用McNemar检验比较mNGS技术与传统病原学检测方法诊断肺部感染的差异,并分别比较两者在有无基础疾病、感染类型中的检出率.结果 所有患者与有基础疾病患者mNGS检测阳性率(87.29%、91.75%)均高于传统病原学检测(55.08%、58.76%)(P<0.05);mNGS检测阳性、阴性结果耗时均短于传统病原学检测(P<0.05);mNGS检测阳性样本高丰度序列占比83.50%(86/103)最高;mNGS在单一型感染及混合型感染的检出率(84.34%、94.29%)均高于传统病原学检测(57.83%、48.57%)(P<0.05).4例经mNGS技术检出耐药基因,共检出5种耐药基因,包括超广谱β-内酰胺酶基因(TEM、SHV、OXA)与碳青霉烯酶基因(IMI、KPC).结论 mNGS技术可有效提高不明原因肺部感染阳性检出率,可辅助评估抗菌药物耐药性基因,在诊断病毒感染、耶氏肺孢子虫感染及混合感染等方面的效果比传统病原学检