目的 分析长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在鼻咽癌与慢性鼻咽炎组织中表达水平的变化,寻找可能与鼻咽癌发生发展相关的特异lncRNA.方法 采用lncRNA芯片技术分析lncRNA和mRNA在鼻咽癌与慢性鼻咽炎组织的表达谱,筛选差异表达的lncRNA和mRNA,进一步研究使用了聚类分析、GO分析、pathway分析等生物信息学技术.结果 差异表达的lncRNA(2倍以上变化且P＜0.05)共856条,其中上调的共425条,下调的共431条;差异表达的mRNA共767条,其中上调的共426条,下调的共341条.利用聚类分析方法将差异表达的lncRNA分成3类:增强子型lncRNA、HOX基因簇、基因间lncRNA.GO分析将mRNA分成3类:生物学过程类、细胞组分类、分子功能类.Pathway分析显示mRNA共参与28条信号通路,其中参与细胞因子-细胞因子受体相互作用信号通路的上调差异表达的mRNA的富集度最高.结论 与慢性鼻咽炎相比,lncRNA在鼻咽癌组织的表达水平明显改变,提示差异表达的lncRNA可能与鼻咽癌的发生发展有关.
作者：杨青青；邓燕飞
来源：肿瘤防治研究 2015 年 42卷 3期
