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目的 了解2017年4月1日-2018年3月31日期间北京市东城区新甲型H1N1流感病毒流行特征,并分析细胞株和鸡胚株血凝素(HA)基因遗传变异情况.方法 收集2017年4月1日-2018年3月31日期间北京市东城区流感数据,分析新甲型H1N1流感的流行特征;用实时荧光PCR(RT-PCR)方法 对选取的7株新甲型H1N1细胞分离株和其相对应的7株鸡胚株进行HA基因序列扩增并测序,用DNASTAR 5.0和MEGA 6.0软件对测序结果 进行系统进化树和遗传特征分析.结果 2017年4月1日-2018年3月31日期间在北京市东城区共检测样本1 780份,新甲型H1N1阳性99份,阳性率是5.56%,细胞分离出新甲型H1N1为51株,鸡胚株为15株.测序成功的13株毒株与世界卫生组织(WHO)推荐的北半球疫苗株A/Michigan/45/2015(甲型/密歇根/45/2015)在系统进化树上位于同一大分支上,同源性较高.其核苷酸同源性为98.96%~100.00%,氨基酸同源性为97.92%~100.00%.其中S74R、P137S、S164T、S183P、T185N、T216K、I267T共7个氨基酸位点(包含抗原决定簇位点)发生改变,决定流感毒力的D222位点和二硫键未发生改变.结论 目前北京市东城区新甲型H1N1流感病毒与疫苗株匹配性较高,但是其HA序列中氨基酸位点变异仍存在,要长期从分子水平进行监测,预防新甲型H1N1流感发生大流行.

作者:李艳宇;李姗姗;杜嘉鑫;高鹏

来源:职业与健康 2020 年 36卷 20期

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作者:
李艳宇;李姗姗;杜嘉鑫;高鹏
来源:
职业与健康 2020 年 36卷 20期
标签:
新甲型H1N1流感病毒 HA基因 鸡胚株 序列分析 进化树
目的 了解2017年4月1日-2018年3月31日期间北京市东城区新甲型H1N1流感病毒流行特征,并分析细胞株和鸡胚株血凝素(HA)基因遗传变异情况.方法 收集2017年4月1日-2018年3月31日期间北京市东城区流感数据,分析新甲型H1N1流感的流行特征;用实时荧光PCR(RT-PCR)方法 对选取的7株新甲型H1N1细胞分离株和其相对应的7株鸡胚株进行HA基因序列扩增并测序,用DNASTAR 5.0和MEGA 6.0软件对测序结果 进行系统进化树和遗传特征分析.结果 2017年4月1日-2018年3月31日期间在北京市东城区共检测样本1 780份,新甲型H1N1阳性99份,阳性率是5.56%,细胞分离出新甲型H1N1为51株,鸡胚株为15株.测序成功的13株毒株与世界卫生组织(WHO)推荐的北半球疫苗株A/Michigan/45/2015(甲型/密歇根/45/2015)在系统进化树上位于同一大分支上,同源性较高.其核苷酸同源性为98.96%~100.00%,氨基酸同源性为97.92%~100.00%.其中S74R、P137S、S164T、S183P、T185N、T216K、I267T共7个氨基酸位点(包含抗原决定簇位点)发生改变,决定流感毒力的D222位点和二硫键未发生改变.结论 目前北京市东城区新甲型H1N1流感病毒与疫苗株匹配性较高,但是其HA序列中氨基酸位点变异仍存在,要长期从分子水平进行监测,预防新甲型H1N1流感发生大流行.