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目的:基于网络药理学方法探讨白芷治疗溃疡性结肠炎(UC)作用机制.方法:通过TCMSP筛选白芷的活性成分;采用uniprot数据库筛选矫正白芷的活性成分对应靶点,采用Cytoscape3.8.2 软件构建"白芷-白芷活性成分-活性成分作用靶基因"网络图;利用OMIM、Drugbank、TTD、Genecards四个疾病靶点数据库获取UC的相关靶点,利用韦恩(VENNY)获取白芷与UC的交集靶点,然后将其导入STRING数据库进行蛋白质互作网络(PPI)网络构建;采用Cytoscape3.8.2 软件构建"白芷-UC交集靶点-作用通路"网络图;最后运用Metascape数据库对交集靶点进行GO功能富集分析与KEGG通路富集分析.结果:筛选得到白芷活性成分 10 个,作用靶点 61 个,溃疡性结肠炎靶点 1329 个,预测得到白芷与溃疡性结肠炎的共同靶点 17 个,GO功能富集分析显示 972 个生物过程,15 个细胞成分和 78 个分子功能,KEGG通路富集分析获得 854 条信号通路.可推测白芷是通过β-谷甾醇、豆甾醇、别欧前胡素等成分介导CASP3、BAX、BCL-2、PTGS2 等靶点调节细胞凋亡的执行阶段、蛋白质均质二聚活性、蛋白质结构域特异性结合、蛋白酶结合、蛋白激酶结合、泛素蛋白连接酶结合、脂质结合等基因功能和细胞的凋亡通路、对细胞周期的负调节、成纤维细胞增殖的调节、microRNAs、结直肠癌通路等

作者:唐婕;严建

来源:中医药临床杂志 2023 年 35卷 5期

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作者:
唐婕;严建
来源:
中医药临床杂志 2023 年 35卷 5期
标签:
白芷 溃疡性结肠炎 作用机制 分子对接 网络药理学
目的:基于网络药理学方法探讨白芷治疗溃疡性结肠炎(UC)作用机制.方法:通过TCMSP筛选白芷的活性成分;采用uniprot数据库筛选矫正白芷的活性成分对应靶点,采用Cytoscape3.8.2 软件构建"白芷-白芷活性成分-活性成分作用靶基因"网络图;利用OMIM、Drugbank、TTD、Genecards四个疾病靶点数据库获取UC的相关靶点,利用韦恩(VENNY)获取白芷与UC的交集靶点,然后将其导入STRING数据库进行蛋白质互作网络(PPI)网络构建;采用Cytoscape3.8.2 软件构建"白芷-UC交集靶点-作用通路"网络图;最后运用Metascape数据库对交集靶点进行GO功能富集分析与KEGG通路富集分析.结果:筛选得到白芷活性成分 10 个,作用靶点 61 个,溃疡性结肠炎靶点 1329 个,预测得到白芷与溃疡性结肠炎的共同靶点 17 个,GO功能富集分析显示 972 个生物过程,15 个细胞成分和 78 个分子功能,KEGG通路富集分析获得 854 条信号通路.可推测白芷是通过β-谷甾醇、豆甾醇、别欧前胡素等成分介导CASP3、BAX、BCL-2、PTGS2 等靶点调节细胞凋亡的执行阶段、蛋白质均质二聚活性、蛋白质结构域特异性结合、蛋白酶结合、蛋白激酶结合、泛素蛋白连接酶结合、脂质结合等基因功能和细胞的凋亡通路、对细胞周期的负调节、成纤维细胞增殖的调节、microRNAs、结直肠癌通路等