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目的:预测黄芪对溃疡性结肠炎(UC)的可能作用靶点与机制,为临床应用黄芪治疗UC的后续研究提供参考.方法:经中药系统药理学分析平台数据库(TCMSP)和UniProt KB数据库检索黄芪的活性成分及其对应靶点基因,经Gene Cards数据库检索UC疾病相关靶点基因,借助Venny 2.1.0在线作图工具获取黄芪与UC的交集靶点基因,并应用Cytoscape 3.7.0软件构建"药物-化合物-交集靶点"相互作用网络.利用STRING数据库获取交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用关系(PPI)网络,并应用Cyto-scape 3.7.0软件进行可视化分析和拓扑学分析以获取核心靶点基因.借助DAVID数据库对交集靶点基因进行基因本体(GO)功能注释及KEGG通路富集,并应用Cytoscape 3.7.0软件构建"靶点-通路"富集网络.通过AutoDock vina 1.1.2软件将度值排名前5位的活性成分与核心靶点基因编码蛋白进行分子对接,应用Discovery Studio 3.5软件绘制结合模式图.结果:黄芪中共有化合物143个,共筛选出了活性成分20个,对应的靶点基因189个;UC疾病相关靶点基因共4356个.黄芪(涉及14种活性成分)与UC的交集靶点基因有126个.PPI网络中的核心靶点基因为AKT1、MAPK1、RB1、JUN等.GO功能注释共得到GO条目2294个(q值<0.05),包括生物过程条目2093个(如对脂多糖的反应、对细菌来源分子的反应等

作者:郝民琦;王佳慧;李晓玲;李海龙;吴玉泓

来源:中国药房 2021 年 32卷 10期

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作者:
郝民琦;王佳慧;李晓玲;李海龙;吴玉泓
来源:
中国药房 2021 年 32卷 10期
标签:
黄芪 活性成分 溃疡性结肠炎 网络药理学 分子对接 作用机制
目的:预测黄芪对溃疡性结肠炎(UC)的可能作用靶点与机制,为临床应用黄芪治疗UC的后续研究提供参考.方法:经中药系统药理学分析平台数据库(TCMSP)和UniProt KB数据库检索黄芪的活性成分及其对应靶点基因,经Gene Cards数据库检索UC疾病相关靶点基因,借助Venny 2.1.0在线作图工具获取黄芪与UC的交集靶点基因,并应用Cytoscape 3.7.0软件构建"药物-化合物-交集靶点"相互作用网络.利用STRING数据库获取交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用关系(PPI)网络,并应用Cyto-scape 3.7.0软件进行可视化分析和拓扑学分析以获取核心靶点基因.借助DAVID数据库对交集靶点基因进行基因本体(GO)功能注释及KEGG通路富集,并应用Cytoscape 3.7.0软件构建"靶点-通路"富集网络.通过AutoDock vina 1.1.2软件将度值排名前5位的活性成分与核心靶点基因编码蛋白进行分子对接,应用Discovery Studio 3.5软件绘制结合模式图.结果:黄芪中共有化合物143个,共筛选出了活性成分20个,对应的靶点基因189个;UC疾病相关靶点基因共4356个.黄芪(涉及14种活性成分)与UC的交集靶点基因有126个.PPI网络中的核心靶点基因为AKT1、MAPK1、RB1、JUN等.GO功能注释共得到GO条目2294个(q值<0.05),包括生物过程条目2093个(如对脂多糖的反应、对细菌来源分子的反应等