目的:构建焦亡相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)风险模型,以预测原发性肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的预后.方法:从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中下载TCGA-HCC 转录本数据和临床病理信息,从HCC 的表达数据中提取焦亡相关基因的表达矩阵,采用Pearson相关分析识别出焦亡基因相关的lncRNA.通过差异分析、单变量COX回归筛选差异表达的焦亡相关lncRNAs,多因素COX回归分析构建焦亡相关lncRNAs风险模型.通过 1 年、2 年和 3 年生存率的AUC 值、风险因素的AUC 值和DCA验证风险模型评分性能.结果:基于 14 个焦亡相关 lncRNAs(MKLN1-AS、NRAV、LINC00205、PTOV1-AS1、SNHG20、FAM111A-DT、SNHG4、AC074117.1、AC091057.1、PXN-AS1、AL031985.3、AC025178.2、AC016747.1、AC099850.4)的风险模型被成功构建,在低危组的患者的预后优于高危组(P＜0.001),并且在预测HCC预后方面优于传统的临床病理特征.此外,免疫检查点PDCD-1(PD-1)、CD274(PD-L1)、HAVCR2 和IDO2 在两个风险组之间也有不同的表达.结论:本研究开发的焦亡相关lncRNA风险模型预测HCC患者的预后优于传统的临床病理特征.
作者：张海航；吴祎；卢彦达
来源：包头医学院学报 2023 年 39卷 6期
