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目的 验证已建立的大肠埃希菌(Escherichia coli,ECO)蛋白指纹图谱实验诊断模型在细菌快速鉴定中的应用价值.方法 利用前期建立的基于ECO蛋白标志物和Fingerwave软件的蛋白指纹诊断模型,对2014年临床分离的163株细菌进行盲法检测.通过与传统微生物学及分子生物学鉴定方法相比较,计算模型的诊断符合率,以验证模型的诊断识别能力.结果 163株细菌检测到29个共有蛋白质峰,经聚类分析后将前期建模的19个蛋白质峰表达丰度导入Fingerwave软件,设置判定阈值为0.7,利用该模型的判定结果与传统微生物学鉴定方法及分子生物学方法相比较,其符合率为86.5%(141/163).结论 细菌蛋白指纹诊断模型在ECO快速鉴定中具潜在应用价值,但需进一步优化建库的各细菌蛋白质峰谱,建立标准化流程和质量控制规则.

作者:姜伟;肖代雯;杨永长;刘华;喻华;黄文芳;李顺君

来源:成都医学院学报 2015 年 10卷 3期

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作者:
姜伟;肖代雯;杨永长;刘华;喻华;黄文芳;李顺君
来源:
成都医学院学报 2015 年 10卷 3期
标签:
大肠埃希菌 蛋白指纹 诊断模型 快速鉴定 Escherichia coli Protein fingerprint Diagnostic model Rapid identification
目的 验证已建立的大肠埃希菌(Escherichia coli,ECO)蛋白指纹图谱实验诊断模型在细菌快速鉴定中的应用价值.方法 利用前期建立的基于ECO蛋白标志物和Fingerwave软件的蛋白指纹诊断模型,对2014年临床分离的163株细菌进行盲法检测.通过与传统微生物学及分子生物学鉴定方法相比较,计算模型的诊断符合率,以验证模型的诊断识别能力.结果 163株细菌检测到29个共有蛋白质峰,经聚类分析后将前期建模的19个蛋白质峰表达丰度导入Fingerwave软件,设置判定阈值为0.7,利用该模型的判定结果与传统微生物学鉴定方法及分子生物学方法相比较,其符合率为86.5%(141/163).结论 细菌蛋白指纹诊断模型在ECO快速鉴定中具潜在应用价值,但需进一步优化建库的各细菌蛋白质峰谱,建立标准化流程和质量控制规则.