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目的 通过网络药理学和生物信息学方法探讨丹参治疗骨关节炎(O A)的潜在活性成分及作用机制.方法 通过检索中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)中丹参成分,筛选丹参活性成分和作用靶点;检索DisGeNET、Drug bank、OMIM、TTD、Gene Cards、GAD、HPO、PharmGKB、Uniprot疾病数据库中OA相关靶点;检索GEO数据库,多基因芯片联合分析,筛选OA差异表达基因.构建丹参活性成分、丹参作用靶点及OA相关靶点间的相互关系网络,通过网络拓扑分析,筛选丹参治疗OA关键靶点,构建蛋白互作(PPI)网络;采用GO功能和KEGG信号通路富集,分析丹参治疗OA的作用机制,利用分子对接技术验证成分与靶点的结合作用.结果 共筛选出57个丹参活性成分,382个O A差异表达基因和68个丹参活性成分与O A共同靶点.结论 丹参治疗OA具有多成分、多靶点、多通路的潜在作用机制,为后续丹参与OA的实验和临床研究提供了思路.

作者:赵昱东;夏雨;邝高艳;沈浮;张海燕;朱明双

来源:成都医学院学报 2021 年 16卷 5期

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作者:
赵昱东;夏雨;邝高艳;沈浮;张海燕;朱明双
来源:
成都医学院学报 2021 年 16卷 5期
标签:
丹参;骨关节炎;网络药理学;生物信息学;分子对接;基因芯片
目的 通过网络药理学和生物信息学方法探讨丹参治疗骨关节炎(O A)的潜在活性成分及作用机制.方法 通过检索中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)中丹参成分,筛选丹参活性成分和作用靶点;检索DisGeNET、Drug bank、OMIM、TTD、Gene Cards、GAD、HPO、PharmGKB、Uniprot疾病数据库中OA相关靶点;检索GEO数据库,多基因芯片联合分析,筛选OA差异表达基因.构建丹参活性成分、丹参作用靶点及OA相关靶点间的相互关系网络,通过网络拓扑分析,筛选丹参治疗OA关键靶点,构建蛋白互作(PPI)网络;采用GO功能和KEGG信号通路富集,分析丹参治疗OA的作用机制,利用分子对接技术验证成分与靶点的结合作用.结果 共筛选出57个丹参活性成分,382个O A差异表达基因和68个丹参活性成分与O A共同靶点.结论 丹参治疗OA具有多成分、多靶点、多通路的潜在作用机制,为后续丹参与OA的实验和临床研究提供了思路.