目的 探索获得性免疫缺陷综合征(AIDS)患者易感抑郁症的关键差异表达基因,为进一步研究寻找靶点.方法 通过GEO数据库下载AIDS合并抑郁症患者和AIDS患者额叶皮层灰质细胞的基因芯片数据集GSE17440,利用R语言挖掘差异表达基因,通过STRING、metascape等工具进行生物信息学分析.结果 挖掘出差异表达基因71个,其中上调基因16个,下调基因55个.经过不同的富集工具富集,差异表达基因主要集中于细胞凋亡通路.构建蛋白与蛋白互相作用的网络图显示,差异表达基因的表达产物大部分存在密切的相互作用,AIDS合并抑郁症患者脑部组织免疫防御反应异常激活.结论 通过对AIDS合并抑郁症患者和AIDS患者差异表达基因的分析,对其差异基因有了系统的认识,针对关键基因的大样本研究及网络化基因分析是未来的研究方向.
作者:熊萱;张远;喻冬柯;童荣生
来源:重庆医学 2020 年 49卷 13期