目的:基于生物信息学确定口腔鳞状细胞癌(OSCC)中m6A相关的生物标志物并评价其诊断性能.方法:从TCGA数据库中提取OSCC的基因表达谱.通过"DESeq2"R包鉴定差异表达的m6A调控因子.使用"ClusterProfiler"R包进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科(KEGG)路径富集分析.利用STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络.利用 Cytoscape 软件的分子复合物检测(MCODE)插件对hub基因进行鉴定.采用受试者工作特征曲线(ROC)验证hub基因的诊断能力.采用"corrplot"包分析诊断基因之间的相关性.结果:共筛选出 14 个差异表达的m6A调控因子,并且全部被选为枢纽基因,其中 IGF2BP1、IGF2BP2、IGF2BP3、RBM15B、HNRNPA2B1、YTHDC2、HNRNPC、RBM15、YTHDF1 基因可以作为区分正常与 OSCC 的特征参数.结论:本研究确定了 IGF2BP1、IGF2BP2、IGF2BP3、RBM15B、HNRNPA2B1、YTHDC2、HNRNPC、RBM15 和YTHDF1 为OSCC的诊断基因;这些基因可能成为OSCC患者潜在的诊断和治疗的靶点.
作者：李姣
来源：长治医学院学报 2023 年 37卷 4期
