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目的 通过 GEO数据库筛选口腔鳞癌相关的差异表达mRNA,并通过体外功能实验明确 ADAMTS2 对口腔鳞癌转移的作用及机制.方法 运用 GEO2R对两个表达谱进行差异基因分析,通过 String 构建 PPI 网络,利用 Cyto-scape中的 Hubba和 Mcode插件筛选关键基因,并通过 GEPIA 和 Kaplan-Meier Plotter 对筛选到的重要基因进行表达量和生存曲线的分析.随后,选定 ADAMTS2 作为研究主题,通过LinkedOmic数据库对ADAMTS2 相关联的基因进行识别,并对Top 50 正负相关基因进行功能富集分析.最后,通过体外实验对 ADAMTS2 在口腔鳞癌细胞中的功能进行验证.结果 在细胞迁移和侵袭实验中,过表达 ADAMTS2 的 SCC15 和 HSC3 细胞迁移和侵袭能力高于对照组,敲低ADAMTS2 则降低了口腔鳞癌细胞的迁移、侵袭能力;OSCC中的差异表达基因与 ADAMTS2 呈正相关;Top 50 与 AD-AMTS2 相关的基因主要与 IL-17 信号通路、细胞迁移的正向调节、血管生成的调节以及糖原代谢过程相关;ADAMTS2通过PI3K-Akt促进口腔鳞状细胞癌(OSCC)的糖酵解,进而促进 OSCC 细胞的转移和侵袭.结论 ADAMTS2 可能是OSCC转移和不良预后的潜在关键基因.

作者:周兵;付东杰;姜蕾

来源:华中科技大学学报(医学版) 2023 年 52卷 4期

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作者:
周兵;付东杰;姜蕾
来源:
华中科技大学学报(医学版) 2023 年 52卷 4期
标签:
口腔鳞状细胞癌 GEO 转移 生存分析 oral squamous cell carcinoma GEO transfer survival analysis
目的 通过 GEO数据库筛选口腔鳞癌相关的差异表达mRNA,并通过体外功能实验明确 ADAMTS2 对口腔鳞癌转移的作用及机制.方法 运用 GEO2R对两个表达谱进行差异基因分析,通过 String 构建 PPI 网络,利用 Cyto-scape中的 Hubba和 Mcode插件筛选关键基因,并通过 GEPIA 和 Kaplan-Meier Plotter 对筛选到的重要基因进行表达量和生存曲线的分析.随后,选定 ADAMTS2 作为研究主题,通过LinkedOmic数据库对ADAMTS2 相关联的基因进行识别,并对Top 50 正负相关基因进行功能富集分析.最后,通过体外实验对 ADAMTS2 在口腔鳞癌细胞中的功能进行验证.结果 在细胞迁移和侵袭实验中,过表达 ADAMTS2 的 SCC15 和 HSC3 细胞迁移和侵袭能力高于对照组,敲低ADAMTS2 则降低了口腔鳞癌细胞的迁移、侵袭能力;OSCC中的差异表达基因与 ADAMTS2 呈正相关;Top 50 与 AD-AMTS2 相关的基因主要与 IL-17 信号通路、细胞迁移的正向调节、血管生成的调节以及糖原代谢过程相关;ADAMTS2通过PI3K-Akt促进口腔鳞状细胞癌(OSCC)的糖酵解,进而促进 OSCC 细胞的转移和侵袭.结论 ADAMTS2 可能是OSCC转移和不良预后的潜在关键基因.