目的 通过网络药理学结合分子对接的研究方法预测甘草附子汤治疗类风湿关节炎(RA)的作用靶点,探究其治疗RA的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索甘草附子汤中包含的4种中药的有效成分及其靶基因.从基因表达汇编(GEO)数据库中下载RA数据,筛选RA患者与健康人群关节滑膜组织的差异基因并与甘草附子汤有效成分靶基因取交集,获得甘草附子汤治疗RA的潜在靶基因.通过Cytoscape 3.7.1软件构建中药-活性成分-疾病靶点网络,并分析网络节点度值以筛选关键活性成分.通过蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析得到甘草附子汤治疗RA的关键蛋白靶点,利用Metascape数据库对甘草附子汤治疗RA的潜在靶基因进行基因本体(GO)分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析预测其作用机制.应用AutoDockTools-1.5.6及PyMOL软件进行分子对接,验证甘草附子汤的活性成分与其治疗RA关键靶点的结合能力.结果 获得甘草附子汤治疗RA的潜在靶基因44个.构建的中药-活性成分-疾病靶点网络包含药材节点4个、活性成分节点95个、潜在靶基因节点44个.网络拓扑结构分析显示槲皮素度值最高,可能为甘草附子汤治疗RA的关键活性成分.甘草附子汤治疗RA的机制涉及对无机物的反应等生物过程、膜筏等细胞组分、CXCR趋化因
作者:叶倩仪;牟兴;卢红娟;蔡斌;张璐定;吴歆
来源:海军军医大学学报 2022 年 43卷 11期