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目的 采用基因甲基化芯片技术筛选抗结核药物性肝损伤(anti-tuberculosis drug induced liver injury,ADLI)患者与非肝损伤患者间DNA差异甲基化基因位点.探讨DNA甲基化与ADLI发病机制的关系.方法 选取2016年1月至2017年7月间唐山市第四医院治疗的肺结核初治患者共137例,分为ADLI组(n=65)、非ADLI组(n=72).收集研究对象的临床一般资料及全血标本.选择其中14例(7例ADLI,7例非ADLI)患者,提取全血标本的DNA,利用Illumina 850K芯片技术检测病例组和对照组DNA的差异甲基化情况.对芯片筛选出差异较大的甲基化基因DUSP22、HLA-C,进一步在剩余的65例病例组和58例对照组中采用甲基化特异PCR (MSP)方法验证甲基化水平,并采用荧光定量PCR检测DUSP22、HLA-C基因的mRNA水平.结果 共检测853 307个CpG位点,病例组和对照组差异显著的位点共1 012个,其中高甲基化位点254个,低甲基化位点758个,主要位于基因体区.聚类分析结果显示,在细胞黏附、金属离子结合等过程中存在大量甲基化差异基因.病例组与对照组人类双特异性磷酸酶DUSP22基因、人类白细胞抗原HLA-C基因的甲基化率差异均有统计学意义(65.6% vs 36.9%、37.9% vs 58.5%,P<0.05),对照组中DUSP22 mRNA表达水平高于病例组,而HLA-C mRNA表达水平低于病例组.结论 外周

作者:李玉红;焦连丽;郝明媛;任琦;崔丽华;韩铁生;郑国颖;冯福民

来源:第三军医大学学报 2019 年 41卷 4期

知识库介绍

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作者:
李玉红;焦连丽;郝明媛;任琦;崔丽华;韩铁生;郑国颖;冯福民
来源:
第三军医大学学报 2019 年 41卷 4期
标签:
抗结核药物性肝损伤 DNA甲基化 基因芯片
目的 采用基因甲基化芯片技术筛选抗结核药物性肝损伤(anti-tuberculosis drug induced liver injury,ADLI)患者与非肝损伤患者间DNA差异甲基化基因位点.探讨DNA甲基化与ADLI发病机制的关系.方法 选取2016年1月至2017年7月间唐山市第四医院治疗的肺结核初治患者共137例,分为ADLI组(n=65)、非ADLI组(n=72).收集研究对象的临床一般资料及全血标本.选择其中14例(7例ADLI,7例非ADLI)患者,提取全血标本的DNA,利用Illumina 850K芯片技术检测病例组和对照组DNA的差异甲基化情况.对芯片筛选出差异较大的甲基化基因DUSP22、HLA-C,进一步在剩余的65例病例组和58例对照组中采用甲基化特异PCR (MSP)方法验证甲基化水平,并采用荧光定量PCR检测DUSP22、HLA-C基因的mRNA水平.结果 共检测853 307个CpG位点,病例组和对照组差异显著的位点共1 012个,其中高甲基化位点254个,低甲基化位点758个,主要位于基因体区.聚类分析结果显示,在细胞黏附、金属离子结合等过程中存在大量甲基化差异基因.病例组与对照组人类双特异性磷酸酶DUSP22基因、人类白细胞抗原HLA-C基因的甲基化率差异均有统计学意义(65.6% vs 36.9%、37.9% vs 58.5%,P<0.05),对照组中DUSP22 mRNA表达水平高于病例组,而HLA-C mRNA表达水平低于病例组.结论 外周