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目的 基于网络药理学方法预测桂枝甘草汤治疗心力衰竭潜在作用靶点与通路.方法 通过TCMSP数据库、TCMID数据库、TCM@Taiwan数据库获得桂枝甘草汤化学成分,采用SwissTargetPrediction数据库预测药物潜在靶点信息,通过用DisGeNET数据库、drugbank数据库、TTD数据库获得心力衰竭靶点,采用Venny2.1.0对药物与疾病的靶点进行交集选取,采用Uniprot数据库转换信息,采用Cytoscape构建"有效成分-靶点-疾病"网络,进行蛋白-蛋白相互作用网络(PPI),并通过网络拓扑分析得到桂枝甘草汤治疗心力衰竭的核心靶点,并将核心靶点通过Metascape数据库进行GO分析及KEGG分析.通过Western blot验证网络药理学的预测结果,根据网络药理学结果中degree值及与心力衰竭过程相关程度筛选出3个因子(PKCα、ERK1/2和BCL2),在戊巴比妥钠溶于无血清高糖培养基处理的H9C2细胞中模拟心衰缺血缺氧环境,提取心肌细胞总蛋白,测定PKCα、ERK1/2和BCL2的蛋白含量.结果 通过网络药理学的方法,得到桂枝甘草汤治疗心力衰竭的潜在靶点有190个,它们主要参与循环系统过程、氮化合物的细胞反应、阳离子稳态、MAPK级联的调节等生物过程;参与调控癌症相关通路,钙信号通路、cGMP-PKG信号通路、cAMP信号通路等38条通路.体外细胞模型的Western blot验证实验结果

作者:赵宇曦;赵旭;朱清楠;朱炳睿;张震彬;陈静

来源:南方医科大学学报 2023 年 43卷 5期

知识库介绍

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作者:
赵宇曦;赵旭;朱清楠;朱炳睿;张震彬;陈静
来源:
南方医科大学学报 2023 年 43卷 5期
标签:
网络药理学 桂枝甘草汤 心力衰竭 分子机制
目的 基于网络药理学方法预测桂枝甘草汤治疗心力衰竭潜在作用靶点与通路.方法 通过TCMSP数据库、TCMID数据库、TCM@Taiwan数据库获得桂枝甘草汤化学成分,采用SwissTargetPrediction数据库预测药物潜在靶点信息,通过用DisGeNET数据库、drugbank数据库、TTD数据库获得心力衰竭靶点,采用Venny2.1.0对药物与疾病的靶点进行交集选取,采用Uniprot数据库转换信息,采用Cytoscape构建"有效成分-靶点-疾病"网络,进行蛋白-蛋白相互作用网络(PPI),并通过网络拓扑分析得到桂枝甘草汤治疗心力衰竭的核心靶点,并将核心靶点通过Metascape数据库进行GO分析及KEGG分析.通过Western blot验证网络药理学的预测结果,根据网络药理学结果中degree值及与心力衰竭过程相关程度筛选出3个因子(PKCα、ERK1/2和BCL2),在戊巴比妥钠溶于无血清高糖培养基处理的H9C2细胞中模拟心衰缺血缺氧环境,提取心肌细胞总蛋白,测定PKCα、ERK1/2和BCL2的蛋白含量.结果 通过网络药理学的方法,得到桂枝甘草汤治疗心力衰竭的潜在靶点有190个,它们主要参与循环系统过程、氮化合物的细胞反应、阳离子稳态、MAPK级联的调节等生物过程;参与调控癌症相关通路,钙信号通路、cGMP-PKG信号通路、cAMP信号通路等38条通路.体外细胞模型的Western blot验证实验结果