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目的 鉴定喉鳞状细胞癌(laryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)中自噬相关微小RNA(microRNA,miRNA),探讨其在肿瘤发展中的作用.方法 数据库下载自噬相关基因及各个LSCC样本的miRNA表达谱,用limma包筛选差异表达的miRNA,并构建miRNA与自噬相关基因之间的共表达网络,从而筛选出自噬相关miRNA.Cox回归分析用于评估自噬相关miRNA在LSCC中的预后价值,建立基于自噬相关miRNA的风险指数模型以预测LSCC的预后.结果 最终鉴定了6个关键自噬相关miRNA分别为hsa-miR-100-5p、hsa-miR-143-3p、hsa-miR-3607-5p、hsa-miR-454-3p、hsa-miR-455-5p、hsa-miR-99a-5p,均与LSCC的预后显着相关.富集分析表明所有的关键自噬相关miRNA在mTOR信号传导途径中均显著富集,利用多元Cox回归计算每个样品的风险指数,风险指数较低的患者具有更好的生存结果.结论 关键自噬相关miRNA可以做为LSCC潜在的治疗靶标,基于自噬相关miRNA新构建的风险指数模型可以预测LSCC的预后.

作者:鲁志琴;孙子慧

来源:中国耳鼻咽喉头颈外科 2020 年 27卷 12期

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作者:
鲁志琴;孙子慧
来源:
中国耳鼻咽喉头颈外科 2020 年 27卷 12期
标签:
喉肿瘤 自噬 预后 微RNAs
目的 鉴定喉鳞状细胞癌(laryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)中自噬相关微小RNA(microRNA,miRNA),探讨其在肿瘤发展中的作用.方法 数据库下载自噬相关基因及各个LSCC样本的miRNA表达谱,用limma包筛选差异表达的miRNA,并构建miRNA与自噬相关基因之间的共表达网络,从而筛选出自噬相关miRNA.Cox回归分析用于评估自噬相关miRNA在LSCC中的预后价值,建立基于自噬相关miRNA的风险指数模型以预测LSCC的预后.结果 最终鉴定了6个关键自噬相关miRNA分别为hsa-miR-100-5p、hsa-miR-143-3p、hsa-miR-3607-5p、hsa-miR-454-3p、hsa-miR-455-5p、hsa-miR-99a-5p,均与LSCC的预后显着相关.富集分析表明所有的关键自噬相关miRNA在mTOR信号传导途径中均显著富集,利用多元Cox回归计算每个样品的风险指数,风险指数较低的患者具有更好的生存结果.结论 关键自噬相关miRNA可以做为LSCC潜在的治疗靶标,基于自噬相关miRNA新构建的风险指数模型可以预测LSCC的预后.