目的：建立和优化肿瘤蛋白质组研究的方法系统，并分析人肺鳞癌细胞蛋白质组。方法：用固相 pH梯度双向凝胶电泳分离人肺鳞癌细胞系 NCI H520总蛋白，银染显色， PDQuest 2DE软件分析，对部分蛋白质点用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 ( matrix assisted laser desorption/ionization time of flying mass spectrometry， MALDI TOF MS) 测定其胶内酶解后的肽质指纹图谱，用 PeptIdent软件查询 SWISS PROT数据库。结果：获得了分辨率和重复性均较好的双向电泳银染图谱，图像分析探测到 3块胶的平均蛋白质点数为 (1146± 116)，平均匹配的点数为 (851± 95)，匹配率达 73.7％， 3块胶在蛋白质点位置上具有较好的重复性， IEF方向的平均偏差为 (1.52± 0.22)mm， SDS PAGE方向的平均偏差为 (1.97± 0.13) mm。随机取 60个蛋白质点进行胶内原位酶解 - 质谱指纹图分析得到了 54个蛋白质点的肽质指纹图，查询数据库初步鉴定了 44个蛋白质，其中部分是与细胞周期有关的蛋白，部分是与信号传导有关的蛋白，部分是与癌基因相关的蛋白。结论：通过该研究建立了一套分辨率和重复性均较好的固向 pH梯度双向凝胶电泳分离细胞总蛋白和银染胶内原位酶解后 MALDI TOF MS肽质指纹图分析鉴定方法。通过
作者：詹显全；陈主初；关勇军；李萃；何春梅；梁宋平；谢锦云；陈平
来源：癌症 2001 年 20卷 6期
