目的 评价不同修饰基团的磁性纳米颗粒提取的基因组DNA对高分辨熔解曲线(HRM)进行SNP基因分型能力的影响.方法 以商品化硅基质吸附柱提法基因组DNA提取试剂盒为对照,评价二氧化硅(SiO2)、壳聚糖(CTA)修饰磁珠及四氧化三铁(Fe3 O4)裸核磁珠DNA的提取得率及纯度;针对rs12641369G＞A、rs3114018C＞A、rs2302515C＞G 3个SNP位点,分别取上述方法提取的DNA作为模板进行PCR-HRM检测;以Sanger测序作为“金标准”,评价检测的灵敏度和特异度;通过重复性实验评价其重复性和再现性.结果 4种方法DNA提取质量的比较结果显示,SiO2@Fe3 O4法提取得率与离心柱法相当,且差异无统计学意义(P＞0.05);CTA@Fe3 O4法及Fe3 O4法DNA提取得率均比柱提法低,差异有统计学意义(P＜0.01).灵敏度和特异度实验结果显示,除2例样本的熔解曲线均发生飘移接受复查外,其余标本3个位点均可直接基因分型;4种核酸提取方法的最终分型结果灵敏度和特异度均达到100％.批内和批间重复试验均显示重复性和再现性良好:柱提法3个位点野生型与纯合突变型样本熔解峰Tm值的变异系数在0.6％～0.8％;SiO2@Fe3 O4法3个位点野生型与纯合突变型样本熔解峰Tm值的变异系数在0.5％～0.8％;CTA@Fe3 O4法3个位点野生型与纯合突变型样本熔解峰Tm值的变异系数在0.5％～0.8
作者：张敏；张俊平；杨美娟；李凌霄；郜莉娜；沈明辉；尤崇革
来源：国际检验医学杂志 2019 年 40卷 11期
