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目的 利用数据库和生物信息学的方法分析己糖激酶2(HK2)基因在肾透明细胞癌患者中病理特征和预后相关性.方法 采用Oncomine数据库分析肾透明细胞癌和非肾组织差异最显著的基因,使用GPEIA、The Human Protein Atlas数据库检验mRNA和蛋白质的表达水平,使用LinkedOmics、KM-plotter数据库分析其表达水平与肾透明细胞癌临床病理特征和预后的相关性,使用STRING数据库预测其潜在作用的蛋白质,推测其作用机制.结果 HK2为差异最显著的基因,其在肾透明细胞癌组织中高表达,并且与肾细胞癌的病理分期、T分期、N分期均呈正相关性(均P<0.05),高表达HK2的肾透明细胞癌患者总生存率显著低于低表达者(P<0.05).结论 HK2基因高表达可能与肾透明细胞癌病理分期、高T分期、高N分期和不良预后相关.

作者:李伟;朱东生

来源:国际生物医学工程杂志 2019 年 42卷 5期

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作者:
李伟;朱东生
来源:
国际生物医学工程杂志 2019 年 42卷 5期
标签:
肾透明细胞癌 己糖激酶2 生物信息学 Renal clear cell carcinoma Hexokinase 2 Bioinformatics
目的 利用数据库和生物信息学的方法分析己糖激酶2(HK2)基因在肾透明细胞癌患者中病理特征和预后相关性.方法 采用Oncomine数据库分析肾透明细胞癌和非肾组织差异最显著的基因,使用GPEIA、The Human Protein Atlas数据库检验mRNA和蛋白质的表达水平,使用LinkedOmics、KM-plotter数据库分析其表达水平与肾透明细胞癌临床病理特征和预后的相关性,使用STRING数据库预测其潜在作用的蛋白质,推测其作用机制.结果 HK2为差异最显著的基因,其在肾透明细胞癌组织中高表达,并且与肾细胞癌的病理分期、T分期、N分期均呈正相关性(均P<0.05),高表达HK2的肾透明细胞癌患者总生存率显著低于低表达者(P<0.05).结论 HK2基因高表达可能与肾透明细胞癌病理分期、高T分期、高N分期和不良预后相关.