目的 检测环状RNA (circRNA)在肾透明细胞癌组织及癌旁肾实质组织中表达谱的差异性.方法 收集2018年12月在郑州大学第一附属医院泌尿外科经病理确诊的4对肾透明细胞癌及癌旁组织标本,进行circRNA高通量测序;分析并比较肾透明细胞癌组织及癌旁组织中circRNA的表达谱差异,筛选出差异有统计学意义的circRNA;随机选取4个差异表达的circRNAs进行实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)对测序结果进行验证;对差异circRNA进行基因本体论(GO)富集、京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路和蛋白互作网络分析.结果 高通量测序共发现circRNA 20 668个,主要源自亲本基因的外显子区域;具有统计学意义差异表达的(｜log2FC｜≥1,P＜0.05) circRNA共578个,其中癌组织中较癌旁组织表达上调的320个,下调的258个;4个差异性circRNAs组织PCR验证结果与高通量测序结果差异无统计学意义(t=0.471、0.253、0.390、0.881,P＞0.05).GO分析和KEGG分析显示,显著差异表达的circRNA涉及肾透明细胞癌细胞成分、分子功能、信号通路等多种生物学过程;蛋白互作网络分析则提示,差异circRNA亲本基因编码蛋白关系密切.结论 circRNA、其亲本基因及相关编码蛋白在肾透明细胞癌的发生发展过程中具有重要作用.
作者：王军；邢会武；刘博文；顾朝辉
来源：中华实验外科杂志 2019 年 36卷 9期
