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目的:对Hoehn-Yahr分级为1期的帕金森病(PD)患者外周血进行基因芯片研究,分析PD患者外周血基因表达的变化.方法:从GEO数据库中获得Hoehn-Yahr分级为1期的PD患者外周血基因数据集GSE54536.运用GEO2R筛选差异表达基因,DAVID工具进行富集基因功能和通路分析.STRING数据库构建差异表达基因蛋白相互作用的网络,应用CytoScape软件筛选核心基因.结果:共筛选到997个差异基因,涉及细胞间信号转导、细胞分泌等生物学过程及PI3K-Akt等信号通路.c-fos、KDM6B、ESR1等为核心基因.结论:通过对Hoehn-Yahr分级为1期的PD患者外周血的基因芯片进行研究,提示PD为多种基因,多种分子机制相互作用的结果,对相关分子机制的研究有助于进一步阐明PD患者的发病机制.

作者:白超博;佡剑非

来源:神经损伤与功能重建 2018 年 13卷 2期

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作者:
白超博;佡剑非
来源:
神经损伤与功能重建 2018 年 13卷 2期
标签:
帕金森病 Hoehn-Yahr分级 差异表达基因 通路富集分析 Parkinson disease Hoehn-Yahr scale differentially expressed gene pathway enrichment analysis
目的:对Hoehn-Yahr分级为1期的帕金森病(PD)患者外周血进行基因芯片研究,分析PD患者外周血基因表达的变化.方法:从GEO数据库中获得Hoehn-Yahr分级为1期的PD患者外周血基因数据集GSE54536.运用GEO2R筛选差异表达基因,DAVID工具进行富集基因功能和通路分析.STRING数据库构建差异表达基因蛋白相互作用的网络,应用CytoScape软件筛选核心基因.结果:共筛选到997个差异基因,涉及细胞间信号转导、细胞分泌等生物学过程及PI3K-Akt等信号通路.c-fos、KDM6B、ESR1等为核心基因.结论:通过对Hoehn-Yahr分级为1期的PD患者外周血的基因芯片进行研究,提示PD为多种基因,多种分子机制相互作用的结果,对相关分子机制的研究有助于进一步阐明PD患者的发病机制.