目的 分析缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)基因表达芯片数据,筛选IS差异表达基因,利用生物信息分析其相关基因功能和信号通路,为IS发病机制提供分子理论基础.方法 从GEO数据库下载IS芯片表达数据,采用DESeq2、edgeR和limma包进行差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)的筛选.采用clusterProfiler包对DEGs进行GO功能和KEGG信号通路富集分析,应用STRING软件构建蛋白-蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络,使用MCODE和cytoHubba插件筛选与IS发病密切相关的模块及枢纽基因.最后结合LASSO回归分析获取特征基因并利用ROC曲线评估其在IS中的诊断价值.结果 检索获得GSE22255、GSE58294 和GSE165613 个IS数据集,共包含 195 个外周血样本,合并表达矩阵获得包含 89 个IS病例和 43 个健康对照人群的新数据集,差异分析获得 196 个DEGs.GO功能和KEGG信号通路富集分析结果显示,上述基因共同介导应激反应、对刺激反应的调节等相关生物过程;参与沙门氏菌感染、NOD样受体和造血细胞谱系等的信号通路.PPI网络和Cytoscape分析获得排名前 10 的枢纽基因.LASSO回归分析获得11 个特征基因与网络分析获得的 10 个枢纽基因交集,最终获得 4 个关键特征基因,分别是趋化因子受体 7(CCR7)、基质金属蛋白酶 9(

作者：李晴晴；李小霞；赵燚；张毓洪；常晓玉

来源：宁夏医科大学学报 2023 年 45卷 10期