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目的 由于宫颈癌的临床确诊与预后不佳,急需寻找到用于筛查宫颈癌发病过程的生物标志物.方法 本文通过对TCGA数据库中来源于宫颈癌样本的高通量转录组测序(含mRNA及miRNA)进行生物信息学数据挖掘,筛选在癌症和癌旁组织中差异表达的miRNA及mRNA,并与宫颈癌患者的临床数据做关联分析.结果 从18个差异表达的miRNA中筛选出4个miRNA(hsa-mir-101-2、hsa-mir-128-1、hsa-mir-145和hsa-mir-642a)与宫颈癌的生存显著相关,可作为宫颈癌的生物标志物;同时系统分析了这4个miRNA的下游1037个靶基因及其所参与的信号通路(如MAPK信号通路、FOXO信号通路和miRNA in Cancer信号通路).结论 宫颈癌患者中这四个差异表达的miRNA(mir-hsa-mir-101-2、hsa-mir-128-1、hsa-mir-145和hsa-mir-642a)可作为宫颈癌的生物标志物,对转录组数据的深入挖掘为宫颈癌的深入研究提供新的思路.

作者:杜宜兰;邓娟;贾宁

来源:国际遗传学杂志 2019 年 42卷 6期

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作者:
杜宜兰;邓娟;贾宁
来源:
国际遗传学杂志 2019 年 42卷 6期
标签:
宫颈癌 miRNA 生物标志物 信号通路 Cervical and endocervical cancer (CESC) miRNA Biomarkers Signaling pathway
目的 由于宫颈癌的临床确诊与预后不佳,急需寻找到用于筛查宫颈癌发病过程的生物标志物.方法 本文通过对TCGA数据库中来源于宫颈癌样本的高通量转录组测序(含mRNA及miRNA)进行生物信息学数据挖掘,筛选在癌症和癌旁组织中差异表达的miRNA及mRNA,并与宫颈癌患者的临床数据做关联分析.结果 从18个差异表达的miRNA中筛选出4个miRNA(hsa-mir-101-2、hsa-mir-128-1、hsa-mir-145和hsa-mir-642a)与宫颈癌的生存显著相关,可作为宫颈癌的生物标志物;同时系统分析了这4个miRNA的下游1037个靶基因及其所参与的信号通路(如MAPK信号通路、FOXO信号通路和miRNA in Cancer信号通路).结论 宫颈癌患者中这四个差异表达的miRNA(mir-hsa-mir-101-2、hsa-mir-128-1、hsa-mir-145和hsa-mir-642a)可作为宫颈癌的生物标志物,对转录组数据的深入挖掘为宫颈癌的深入研究提供新的思路.