目的：通过建立人表皮生长因子受体-2（HER-2）阴性和阳性乳腺癌的蛋白质表达谱寻找二者间的差异表达蛋白，为乳腺癌患者提供新的预后指标和治疗靶点。方法应用蛋白质组学同位素相对标记与绝对定量（iTRAQ）技术建立 HER-2阳性和阴性乳腺癌的蛋白质差异表达谱，分离并鉴定两组乳腺癌的差异表达蛋白，对部分差异表达蛋白进行生物信息学分析，包括蛋白功能注释和分类 GO 分析、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析。结果应用 iTRAQ 对乳腺癌组织进行蛋白组学分析，鉴定出 HER-2阳性和阴性组有差异表达的蛋白4999种，以 HER-2（＋）／HER-2（－）≥3为上调标准，确定 HER-2阳性组上调蛋白119种。以 HER-2（＋）／HER-2（－）≤0．5为下调标准，HER-2阳性组下调蛋白47种。GO 分析结果显示 HER-2阴性和阳性乳腺癌的差异表达蛋白的分子功能、生物过程、细胞组成较为复杂，并且在上调蛋白和下调蛋白上存在分布差异。KEGG 通路分析发现部分差异表达蛋白涉及168条信号通路。结论 HER-2阳性和阴性乳腺癌间存在差异表达蛋白，这些蛋白涉及复杂的分子功能、生物过程和信号通路。
作者：李晶；黄三钱；欧阳取长；钟晶敏；高妮娜；刘莉萍；刘志红；曾亮
来源：国际肿瘤学杂志 2016 年 43卷 10期
