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目的 探索驱动蛋白超家族20A(KIF20A)在肝细胞癌中的表达及临床预后意义.方法 利用GEPIA(Gene Expression Profiling Interactive Analysis)、Oncomine及THPA(The Human Protein Atlas)生物信息学在线分析网站,挖掘分析大型癌症公共数据癌症基因组图谱(TCGA)及GEO(Gene Expression Omnibus)中肝癌KIF20A mRNA及蛋白的表达信息,基于TCGA中的肝癌数据采用Kaplan-Meier法进行生存分析,log-rank法进行生存率的比较,并对KIF20A和磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)信号通路中部分关键分子的表达进行Pearson相关性分析.结果 GEPIA中检索到369例肝癌及50例正常肝组织中包含KIF20A mRNA的表达含量信息,Oncomine中检索到4项有关KIF20AmRNA在肝癌组织中表达差异的研究.结果均发现,与正常肝组织相比,KIF20A mRNA表达水平在肝癌中显著升高(P <0.001;t=8.766,P<0.001;t=24.329,P<0.001;t=7.398,P<0.001;t=3.191,P=0.001).THPA在线网站分析表明,KIF20A蛋白在正常肝组织中呈低表达或不表达,而在肝癌组织中呈现明显高表达.这一结果与mRNA分析结果相一致.生存分析发现,KIF20A表达量与肝癌患者总生存期和无瘤生存期相关,KIF20A表达高的患者预后较差(P =0.003;P<0.001).进一步相关分析发现,肝癌中KIF20A基因表达与

作者:李岩;王伟

来源:国际肿瘤学杂志 2018 年 45卷 11期

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作者:
李岩;王伟
来源:
国际肿瘤学杂志 2018 年 45卷 11期
标签:
肝肿瘤 驱动蛋白 预后 生物信息学 Liver neoplasms Kinesin Prognosis Bioinformatics
目的 探索驱动蛋白超家族20A(KIF20A)在肝细胞癌中的表达及临床预后意义.方法 利用GEPIA(Gene Expression Profiling Interactive Analysis)、Oncomine及THPA(The Human Protein Atlas)生物信息学在线分析网站,挖掘分析大型癌症公共数据癌症基因组图谱(TCGA)及GEO(Gene Expression Omnibus)中肝癌KIF20A mRNA及蛋白的表达信息,基于TCGA中的肝癌数据采用Kaplan-Meier法进行生存分析,log-rank法进行生存率的比较,并对KIF20A和磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)信号通路中部分关键分子的表达进行Pearson相关性分析.结果 GEPIA中检索到369例肝癌及50例正常肝组织中包含KIF20A mRNA的表达含量信息,Oncomine中检索到4项有关KIF20AmRNA在肝癌组织中表达差异的研究.结果均发现,与正常肝组织相比,KIF20A mRNA表达水平在肝癌中显著升高(P <0.001;t=8.766,P<0.001;t=24.329,P<0.001;t=7.398,P<0.001;t=3.191,P=0.001).THPA在线网站分析表明,KIF20A蛋白在正常肝组织中呈低表达或不表达,而在肝癌组织中呈现明显高表达.这一结果与mRNA分析结果相一致.生存分析发现,KIF20A表达量与肝癌患者总生存期和无瘤生存期相关,KIF20A表达高的患者预后较差(P =0.003;P<0.001).进一步相关分析发现,肝癌中KIF20A基因表达与