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目的 利用网络药理学和实验验证探讨蒲黄治疗脊髓损伤的分子机制.方法 使用TCMSP数据库及文献资料筛选蒲黄的有效成分及其对应靶点,使用DrugBank、OMIM、TTD、GeneCard数据库获得脊髓损伤相关靶点.Cytoscape构建蒲黄抗脊髓损伤靶点蛋白相互作用(PPI)网络图及"药物–化合物–靶点"网络图,根据网络图中各靶点的拓扑学参数筛选出蒲黄抗脊髓损伤关键靶点及关键成分.使用DAVID数据库对蒲黄抗脊髓损伤靶点进行基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.采用Autodock Vina软件对关键化合物与关键靶点蛋白进行分子对接验证.动物实验观察蒲黄对脊髓损伤大鼠后肢运动神经功能的影响及对关键靶点蛋白mRNA表达的影响.结果 共筛选出花生四烯酸、异鼠李素、β 谷甾醇、山柰酚、棕榈酸睾酮、山柰酚-3-O-α-L-鼠李糖基(1→2)-β-D-葡萄糖苷、槲皮素、异鼠李素-3-O-新橙皮苷、香蒲新苷等活性成分.PPI网络分析显示,肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素(IL)-6、蛋白激酶B(AKT1)、IL-1B、胱天蛋白酶3(CASP3)等蛋白可能在脊髓损伤的治疗中起关键作用.蒲黄抗脊髓损伤靶点的GO分析显示生物过程主要涉及对脂多糖的反应、对细菌源性分子的反应、细胞对化学应激的反应、活性氧代谢过程的调控过程等.KEGG富集分析显示

作者:王国栋;聂兴国;李琦;寇海龙

来源:现代药物与临床 2022 年 37卷 7期

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作者:
王国栋;聂兴国;李琦;寇海龙
来源:
现代药物与临床 2022 年 37卷 7期
标签:
蒲黄 脊髓损伤 网络药理学 分子对接 槲皮素 山柰酚 异鼠李素 β-谷甾醇
目的 利用网络药理学和实验验证探讨蒲黄治疗脊髓损伤的分子机制.方法 使用TCMSP数据库及文献资料筛选蒲黄的有效成分及其对应靶点,使用DrugBank、OMIM、TTD、GeneCard数据库获得脊髓损伤相关靶点.Cytoscape构建蒲黄抗脊髓损伤靶点蛋白相互作用(PPI)网络图及"药物–化合物–靶点"网络图,根据网络图中各靶点的拓扑学参数筛选出蒲黄抗脊髓损伤关键靶点及关键成分.使用DAVID数据库对蒲黄抗脊髓损伤靶点进行基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.采用Autodock Vina软件对关键化合物与关键靶点蛋白进行分子对接验证.动物实验观察蒲黄对脊髓损伤大鼠后肢运动神经功能的影响及对关键靶点蛋白mRNA表达的影响.结果 共筛选出花生四烯酸、异鼠李素、β 谷甾醇、山柰酚、棕榈酸睾酮、山柰酚-3-O-α-L-鼠李糖基(1→2)-β-D-葡萄糖苷、槲皮素、异鼠李素-3-O-新橙皮苷、香蒲新苷等活性成分.PPI网络分析显示,肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素(IL)-6、蛋白激酶B(AKT1)、IL-1B、胱天蛋白酶3(CASP3)等蛋白可能在脊髓损伤的治疗中起关键作用.蒲黄抗脊髓损伤靶点的GO分析显示生物过程主要涉及对脂多糖的反应、对细菌源性分子的反应、细胞对化学应激的反应、活性氧代谢过程的调控过程等.KEGG富集分析显示