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目的:运用网络药理学的方法预测甘草查尔酮A(LCA)抗鼻咽癌的潜在作用靶点及作用机制.方法:通过PubChem平台获得LCA的3D结构,并用Swiss Target Prediction数据库筛选出LCA靶点以及Uniprot数据库进行靶点蛋白和基因信息校正,得到相应的基因名称数据库.通过人类基因组注释数据库(genecards)搜集与鼻咽癌相关的靶基因,与LCA所对应的靶点作交集,获得共同的潜在靶点.运用STRING数据库构建蛋白质间的相互作用,并进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)功能富集分析,以鉴定分子生物学过程和信号通路.最后,构建"药物-靶点-疾病-通路"网络模型.结果:筛选出鼻咽癌与LCA的共同作用靶点共41个.GO功能富集分析显示生物学过程和功能主要集中在蛋白质磷酸化、凋亡过程的负反馈调节、细胞质以及蛋白质黏合等方面.KEGG功能富集表明富集较多的通路主要有癌症相关信号通路、酒精通路、MAPK信号通路以及癌症微小核糖核酸表达等."药物-靶点-疾病-通路"网络图显示关键基因主要有MAPK14、MAPK10、MAPK1、RAF1等.结论:运用网络药理学方法,预测了LCA治疗鼻咽癌的潜在药物靶点,并初步阐明了其潜在药理机制,为后续研究提供一定的理论依据.

作者:杨萌哲;徐宁;成南南;郭兴喆;白先愚;吕安乔;杨建宇;黄元姣

来源:广西医科大学学报 2021 年 38卷 3期

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杨萌哲;徐宁;成南南;郭兴喆;白先愚;吕安乔;杨建宇;黄元姣
来源:
广西医科大学学报 2021 年 38卷 3期
标签:
鼻咽癌 甘草查尔酮A 网络药理学 药物靶点 作用机制
目的:运用网络药理学的方法预测甘草查尔酮A(LCA)抗鼻咽癌的潜在作用靶点及作用机制.方法:通过PubChem平台获得LCA的3D结构,并用Swiss Target Prediction数据库筛选出LCA靶点以及Uniprot数据库进行靶点蛋白和基因信息校正,得到相应的基因名称数据库.通过人类基因组注释数据库(genecards)搜集与鼻咽癌相关的靶基因,与LCA所对应的靶点作交集,获得共同的潜在靶点.运用STRING数据库构建蛋白质间的相互作用,并进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)功能富集分析,以鉴定分子生物学过程和信号通路.最后,构建"药物-靶点-疾病-通路"网络模型.结果:筛选出鼻咽癌与LCA的共同作用靶点共41个.GO功能富集分析显示生物学过程和功能主要集中在蛋白质磷酸化、凋亡过程的负反馈调节、细胞质以及蛋白质黏合等方面.KEGG功能富集表明富集较多的通路主要有癌症相关信号通路、酒精通路、MAPK信号通路以及癌症微小核糖核酸表达等."药物-靶点-疾病-通路"网络图显示关键基因主要有MAPK14、MAPK10、MAPK1、RAF1等.结论:运用网络药理学方法,预测了LCA治疗鼻咽癌的潜在药物靶点,并初步阐明了其潜在药理机制,为后续研究提供一定的理论依据.