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目的:分析股骨头坏死愈胶囊治疗股骨头坏死(osteonecrosis of femoral head,ONFH)的潜在靶点及作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)和中医药百科全书(encyclopedia of traditional Chinese medicine,ETCM)数据库检索、筛选股骨头坏死愈胶囊的有效成分和靶点.在Gene-Cards数据库中检索ONFH相关基因,从GEO数据库下载包含ONFH基因数据的GSE74089数据集获取ONFH差异表达基因,并通过与已获取的股骨头坏死愈胶囊药物靶点基因取交集,筛选股骨头坏死愈胶囊治疗ONFH的关键靶点.利用Cytoscape软件、STRING数据库及已筛选出的股骨头坏死愈胶囊有效成分和关键靶点,构建药物-成分-靶点蛋白互作网络.利用R软件对筛选出的关键靶点基因进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,挖掘关键靶点的生物学功能和通路信息.利用Cytoscape软件和STRING数据库构建关键靶点蛋白互作网络,筛选股骨头坏死愈胶囊治疗ONFH的核心靶点.结果:从TCMSP和ETCM数据库中共筛选出股骨头坏死愈胶囊的有效成分203个、靶点592个.在GeneCards数据库中检索到ONFH相关基因2033个,在GEO数据库GSE74089数据集获得ONFH差异表达基因8178个.将ONFH相关

作者:张雪;徐彬;刘又文;李无阴;张虹;岳辰

来源:中医正骨 2022 年 34卷 1期

知识库介绍

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作者:
张雪;徐彬;刘又文;李无阴;张虹;岳辰
来源:
中医正骨 2022 年 34卷 1期
标签:
股骨头坏死;股骨头坏死愈胶囊;网络药理学;靶点;药物作用机制
目的:分析股骨头坏死愈胶囊治疗股骨头坏死(osteonecrosis of femoral head,ONFH)的潜在靶点及作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)和中医药百科全书(encyclopedia of traditional Chinese medicine,ETCM)数据库检索、筛选股骨头坏死愈胶囊的有效成分和靶点.在Gene-Cards数据库中检索ONFH相关基因,从GEO数据库下载包含ONFH基因数据的GSE74089数据集获取ONFH差异表达基因,并通过与已获取的股骨头坏死愈胶囊药物靶点基因取交集,筛选股骨头坏死愈胶囊治疗ONFH的关键靶点.利用Cytoscape软件、STRING数据库及已筛选出的股骨头坏死愈胶囊有效成分和关键靶点,构建药物-成分-靶点蛋白互作网络.利用R软件对筛选出的关键靶点基因进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,挖掘关键靶点的生物学功能和通路信息.利用Cytoscape软件和STRING数据库构建关键靶点蛋白互作网络,筛选股骨头坏死愈胶囊治疗ONFH的核心靶点.结果:从TCMSP和ETCM数据库中共筛选出股骨头坏死愈胶囊的有效成分203个、靶点592个.在GeneCards数据库中检索到ONFH相关基因2033个,在GEO数据库GSE74089数据集获得ONFH差异表达基因8178个.将ONFH相关