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目的 基于网络药理学及分子对接技术探讨连理汤治疗溃疡性结肠炎(UC)的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台检索连理汤6味中药的活性化学成分及其作用靶点;通过OMIM?、DrugBank、TTD、DISEASES、GeneCards?等数据库获取UC的相关靶点;对连理汤活性化学成分的作用靶点和UC的相关靶点取交集;使用Cytoscape3.8.2软件构建连理汤治疗UC的"中药-活性成分-靶点"网络以筛选主要活性化学成分.通过STRING数据库及Cytoscape 3.8.2软件构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,筛选核心靶点.应用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.使用AutoDock软件对主要活性化学成分和核心靶点进行分子对接.结果 共获得连理汤活性化学成分110个,作用靶点229个,UC相关靶点1 538个,取交集后获得134个连理汤治疗UC的相关靶点.通过构建"中药-活性成分-靶点"获得槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、异鼠李素、芒柄花黄素等11个主要活性化学成分,通过构建PPI网络筛选出丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素(IL)-6、肿瘤抑癌蛋白p53(TP53)、IL-1B、原癌基因C-Jun(JUN)等10个核心靶点.GO功能富集分析结果显示,交集靶点涉及的生物过程主要与凋亡过程

作者:邓亚胜;黄慧;梁天薇;林江

来源:广西医学 2023 年 45卷 17期

知识库介绍

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邓亚胜;黄慧;梁天薇;林江
来源:
广西医学 2023 年 45卷 17期
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连理汤 溃疡性结肠炎 网络药理学 分子对接 作用机制 Lianli Decoction Ulcerative colitis Network pharmacology Molecular docking Mechanism
目的 基于网络药理学及分子对接技术探讨连理汤治疗溃疡性结肠炎(UC)的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台检索连理汤6味中药的活性化学成分及其作用靶点;通过OMIM?、DrugBank、TTD、DISEASES、GeneCards?等数据库获取UC的相关靶点;对连理汤活性化学成分的作用靶点和UC的相关靶点取交集;使用Cytoscape3.8.2软件构建连理汤治疗UC的"中药-活性成分-靶点"网络以筛选主要活性化学成分.通过STRING数据库及Cytoscape 3.8.2软件构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,筛选核心靶点.应用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.使用AutoDock软件对主要活性化学成分和核心靶点进行分子对接.结果 共获得连理汤活性化学成分110个,作用靶点229个,UC相关靶点1 538个,取交集后获得134个连理汤治疗UC的相关靶点.通过构建"中药-活性成分-靶点"获得槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、异鼠李素、芒柄花黄素等11个主要活性化学成分,通过构建PPI网络筛选出丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素(IL)-6、肿瘤抑癌蛋白p53(TP53)、IL-1B、原癌基因C-Jun(JUN)等10个核心靶点.GO功能富集分析结果显示,交集靶点涉及的生物过程主要与凋亡过程