应用网络药理学及分子对接技术探究槲皮素治疗抑郁的潜在机制.从SwissTargetPrediction、Superpred数据库中筛选出"槲皮素"相关靶点;从OMIM、Genecards数据库中筛选出"抑郁"的相关靶点.通过Jvenn获得二者的共同蛋白质靶点信息后,使用Cytoscape软件构建蛋白质互作网络,并对hub基因进行筛选.使用David平台对相同靶点进行GO、KEGG等富集分析.最后采用分子对接技术进行准确性检验.PPI网络中共有 103 个节点,536 条边,其中SRC、MTOR、EGFR、AKT1、PTK2 等靶点度值排名较高.GO、KEGG富集分析结果表明,槲皮素对抑郁的作用主要涉及凋亡过程的负向调节、信号转导、蛋白磷酸化反应等生物学过程.信号通路主要包括HIF-1、ErbB、磷脂酶D信号传导、神经营养素信号传导等.分子对接结果显示SRC、MTOR、AKT1 等靶点与槲皮素结合程度较好,且在KEGG通路中富集.揭示了槲皮素作用于抑郁的潜在靶点及机制,以期望研制出治疗抑郁症新药物.
作者:杨翼驰;刘芳;聂家奇;冯倩倩;李小松;王素青
来源:生物信息学 2023 年 21卷 4期