采用网络药理学、分子对接、分子动力学模拟等方法,结合沙门菌攻毒试验初步验证小檗碱(berberine,BBR)干预肉鸡肠炎的潜在靶点及作用机制.首先利用 PharMapper数据库和 Swisstargets 数据库预测药物靶点;通过 GeneCards数据库收集疾病靶点,并筛选出药物和疾病靶点的交集,将得到的交集靶点构建蛋白质互作网络及 GO 与KEGG富集分析;对筛选出的核心靶点进行分子对接验证和动力学模拟;后续建立肉鸡肠道炎症模型,观察其肠道组织形态变化,并利用 RT-qPCR验证BBR对靶点蛋白 mRNA表达量的影响.结果显示:最终筛选得到BBR潜在靶点 374 个,与肠炎交集 174 个;GO 与KEGG富集分析分别得到 197 条目和 73 条目,主要涉及信号转导、蛋白磷酸化过程及PI3K-Akt、趋化因子及 Ras等信号通路;分子对接和动力学模拟结果显示,BBR与核心靶点之间均能较好地结合,主要通过疏水作用力、氢键结合;组织切片结果发现,BBR 可显著缓解肠道组织损伤;RT-qPCR结果显示,给药后仔鸡盲肠组织中 HSP90AA1 表达量显著下降(P<0.001),PIK3CA表达量显著上升(P<0.01).通过网络药理学和试验验证发现,BBR可能通过调节 HSP90AA1 和PIK3CA表达量来调控肠道炎症的发生发展,可能涉及PI3K-Akt、cAMP、AMPK等信号通路,为深入进行BBR治疗肠炎的作用机制研究提供
作者:张旭梅;魏玉荣;许丞惠;杨彤;史慧君;付强;杨莉
来源:畜牧兽医学报 2023 年 54卷 8期