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目的:运用网络药理学和分子对接技术分析探讨中药娑罗子治疗脑水肿的潜在靶点及作用机制.方法:基于HERB数据库收集娑罗子化学成分及其靶标基因;通过OMIM、GeneCards、Drug Bank等数据库获取脑水肿疾病靶标基因;将成分靶标、疾病靶标交集部分上传至STRING数据库,构建中药成分靶标-疾病靶标蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并计算网络特征值,筛选出关键靶标.借助Metascape分析平台对关键靶标进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并使用AutoDock软件进行分子对接验证.结果:共获取娑罗子有效活性成分24个,治疗脑水肿交集靶标108个,GO功能富集分析得到2634条生物过程(BP)条目、183条分子功能(MF)条目、72条细胞组分(CC)条目.KEGG通路富集分析结果显示,娑罗子治疗脑水肿涉及的通路包括癌症通路、脂质动脉粥样硬化、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路、血管内皮生长因子(VEGF)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路等.分子对接结果验证了有效成分和关键靶点的相互作用,其中七叶皂苷苷元A、七叶皂苷苷元C与脑水肿相关通路的关键蛋白有较强的对接活性.结论:中药娑罗子治疗脑水肿的效应机制可能与炎症反应、抗氧化应激等相关.

作者:段妍琴;刘胜兰;刘海姣;彭颖;黄建华;刘东亮

来源:湖南中医杂志 2023 年 39卷 8期

知识库介绍

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作者:
段妍琴;刘胜兰;刘海姣;彭颖;黄建华;刘东亮
来源:
湖南中医杂志 2023 年 39卷 8期
标签:
脑水肿 娑罗子 网络药理学 分子对接 作用机制 cerebral edema Semen Aesculi network pharmacology molecular docking mechanism of action
目的:运用网络药理学和分子对接技术分析探讨中药娑罗子治疗脑水肿的潜在靶点及作用机制.方法:基于HERB数据库收集娑罗子化学成分及其靶标基因;通过OMIM、GeneCards、Drug Bank等数据库获取脑水肿疾病靶标基因;将成分靶标、疾病靶标交集部分上传至STRING数据库,构建中药成分靶标-疾病靶标蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并计算网络特征值,筛选出关键靶标.借助Metascape分析平台对关键靶标进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并使用AutoDock软件进行分子对接验证.结果:共获取娑罗子有效活性成分24个,治疗脑水肿交集靶标108个,GO功能富集分析得到2634条生物过程(BP)条目、183条分子功能(MF)条目、72条细胞组分(CC)条目.KEGG通路富集分析结果显示,娑罗子治疗脑水肿涉及的通路包括癌症通路、脂质动脉粥样硬化、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路、血管内皮生长因子(VEGF)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路等.分子对接结果验证了有效成分和关键靶点的相互作用,其中七叶皂苷苷元A、七叶皂苷苷元C与脑水肿相关通路的关键蛋白有较强的对接活性.结论:中药娑罗子治疗脑水肿的效应机制可能与炎症反应、抗氧化应激等相关.